Труды сотрудников ИЛ им. В.Н. Сукачева СО РАН

w10=
Найдено документов в текущей БД: 6

    Генетическое разнообразие и дифференциация популяций лиственницы Гмелина в Эвенкии (Средняя Сибирь)
/ А.Я. Ларионова, Н.В. Яхнева, А.П. Абаимов // Генетика. - 2004. - Т. 40, № 10. - С. 1370-1377. - Библиогр. в конце ст.

Аннотация: На основе анализа 17 генов, кодирующих аллозимное разнообразие 10 ферментов, получены данные о внутри- и межпопуляционной изменчивости лиственницы Гмелина (Larix gmelinii (Rupr.) Rupr.) в Эвенкии. Установлено, что более 50% включенных в исследование структурных генов являются полиморфными, а каждое дерево в среднем гетерозиготно по 9.2% генов. Ожидаемая в соответствии с законом Харди-Вайнберга гетерозиготность несколько выше: 12.5%. Все изученные популяции лиственницы обнаруживают значительный дефицит гетерозиготных генотипов, вызванный инбридингом. Использование . статистик Райта показало, что инбридинг особи относительно популяции (FiS) составляет в среднем 26.6%, относительно вида в целом (Fu) - 27.8%. Наибольший дефицит гетерозиготности среди популяций обнаруживает самая молодая по возрастной структуре популяция П. Свыше 98% выявленной изменчивости реализуется внутри популяции, на долю межпопуляционной составляющей приходится лишь 1.66%. Генетическое расстояние между популяциями варьирует от 0.0025 до 0.0042, составляя в среднем 0.0035.

Полный текст

Держатели документа:
Институт леса им. В.Н. Сукачева Сибирского отделения Российской академии наук : 660036, Красноярск, Академгородок, 50 стр. 28

Доп.точки доступа:
Яхнева, Наталья Викторовна; Yakhneva Natal'ya Viktorovna; Абаимов, Анатолий Платонович; Abaimov, Anatoly Platonovich ; Larionova, Al'bina Yakovlyevna

    Гетерозиготность как фактор роста у карликовых деревьев Pinus sylvestris L. в остепненных борах Сибири
: материалы временных коллективов / И. В. Тихонова, В. Л. Семериков // Лесные экосистемы Северо-Восточной Азии и их динамика: Материалы международной конференции. - Владивосток : Дальнаука, 2006. - С. 247-251. - Библиогр. в конце ст.

Аннотация: Карликовые сосны характеризуются не только большим морфологическим разнообразием по размерам и формам ствола и кроны, но и высокой генотипической изменчивостью. В отличие от них, группа типичных представителей вида не образует сколько-нибудь заметной прерывистой дифференциации по приведенным признакам. Кроме того, карликовые растения характеризуются высокой коррелированностью роста в высоту с гетерозиготностью генотипа, что в норме прослеживается не всегда и, проявляется по мнению Ю.П. Алтухова гораздо слабее в случае недоучета таких признаков, как продолжительность жизни и скорость полового созревания. В нашей небольшой выборке типичных сосен такая связь не просматривается.

Держатели документа:
Институт леса им. В.Н. Сукачева Сибирского отделения Российской академии наук : 660036, Красноярск, Академгородок 50/28

Доп.точки доступа:
Семериков, В.Л.; Semerikov V.L.; Tikhonova Irina Vasil'yevna
Имеются экземпляры в отделах:
РСФ (26.10.2006г. (1 экз.) - Б.ц.) - свободны 1

    О связи гетерозиготности сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) с половым типом и чувствительностью деревьев к воздействию факторов окружающей среды
[Текст] / И. В. Тихонова // Сибирский экологический журнал. - 2015. - Т. 22, № 4. - С. 555-562DOI 10.15372/SEJ20150406. - Библиогр. в конце ст. . -
Аннотация: Рассматриваются корреляции гетерозиготности генотипа с полом и чувствительностью дерева к воздействию экологических факторов. Отмечена достаточно тесная тройственная корреляция между учтенными признаками. Волновой характер связи уровня гетерозиготности деревьев с их чувствительностью к условиям роста при непосредственном участии пола может свидетельствовать о том, что в ряду распределения особей популяции по гетерозиготности существуют оптимальные для данных условий сочетания аллелей гомо- и гетерозиготных локусов. Они проявляются в снижении чувствительности деревьев к факторам окружающей среды при значениях гетерозиготности 0,125 и 0,375. Обнаружено влияние гетерозиготности деревьев сосны на устойчивость их полового типа во времени. Сосны, характеризующиеся наибольшими гормональными перестройками в ответ на изменение условий роста, отличаются более низкими значениями гетерозиготности.

Полный текст,
РИНЦ

Держатели документа:
Институт леса имени В.Н. Сукачева СО РАН : 660036, г. Красноярск, Академгородок №50, стр.28

Доп.точки доступа:
Tikhonova Irina Vasil'yevna

    Изменчивость ядерных микросатиллитных локусов в популяциях кедрового стланика (Pinus pumila (Pallas) Regel) из российской части ареала
[Текст] : материалы временных коллективов / Н. В. Орешкова [и др.] // Генетика. - 2017. - Т. 53, № 3. - С. 324-333, DOI 10.7868/S0016675817020084. - Библиогр. в конце ст. . - ISSN 0016-6758

Аннотация: Проведен анализ изменчивости ядерных микросателлитных локусов у кедрового стланика. Шесть микросателлитных локусов (RPS2, RPS6, RPS12, RPS124, RPS127, Pc18) демонстрируют различный уровень полиморфизма в 10 популяциях кедрового стланика: среднее число аллелей на локус составило 4.88, средняя наблюдаемая гетерозиготность – 0.465, средняя ожидаемая гетерозиготность – 0.510. Около 13% обшей генетической изменчивости объясняется генетическими различиями между популяциями (FST = 0.129). Генетические расстояния между изученными популяциями Pinus pumila, основанные на частотах SSR-маркеров, достоверно коррелировали с географическими расстояниями между выборками. Уровень генетической изменчивости популяций с п-ова Камчатка был ниже по сравнению с материковыми и островными популяциями. Установленная в нашем исследовании генетическая разобщенность камчатско-магаданских и остальных популяций стланика может объясняться их формированием из разных плейстоценовых рефугиумных центров.

https://elibrary.ru/download/elibrary_28917696_40128304.pdf
: 660036, Красноярск, Академгородок, 50, стр. 28

Доп.точки доступа:
Орешкова, Наталья Викторовна; Oreshkova, Natalja Viktorovna; Ветрова, Валентина Петровна; Vetrova, Valentina Petrovna; Горошкевич, С.Н.; Петрова, Е.А.
575.113
Р 17

    Разработка ядерных микросателлитных маркеров с длинными (трех-, четырех-, пяти- и шестинуклеотидными) мотивами для трех видов лиственницы на основе полногеномного de novo секвенирования лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.)
[Текст] : статья / Н. В. Орешкова [и др.] // Генетика. - 2019. - Т. 55, № 4. - С. 418-425, DOI 10.1134/S001667581904009X . - ISSN 0016-6758
   Перевод заглавия: Development of Nuclear Microsatellite Markers with Long (Tri-, Tetra-, Penta-and Hexanucleotide) Motifs for Three Larch Species Based on the de novoWhole Genome Sequencing of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.)
УДК

Аннотация: Лиственница сибирская Larix sibirica Ledeb. является одной из преобладающих бореальных пород в Евразии и имеет высокую экономическую и экологическую ценность. Однако, несмотря на это, разработка и использование микросателлитных маркеров для ее исследования остаются недостаточными. Микросателлитные маркеры уже долгое время являются признанным инструментом для оценки популяционной изменчивости и структуры видов. В настоящей работе был проведен поиск простых три-, тетра-, пента- и гексануклеотидных тандемных повторов в геномной референсной de novo сборке лиственницы сибирской, локусы которой легко генотипируются даже путем простого гель-электрофореза. Всего было найдено более тысячи предположительных микросателлитных локусов. На основе этих данных были разработаны и проверены 60 пар олигонуклеотидных ПЦР праймеров. По итогам тестирования праймеров на образцах ДНК из трех видов лиственницы (L. sibirica Ledeb., L. gmelinii (Rupr.) Rupr. и L. cajanderi Mayr.) были отобраны 14 наиболее перспективных полиморфных локусов, которые могут успешно применяться для изучения и идентификации не только лиственницы сибирской, но также лиственниц Гмелина и Каяндера.
Siberian larch Larix sibirica Ledeb. is one of the major boreal tree species in Eurasia and has a considerable economic and ecological value. Despite that importance, the development and use of microsatellite markers in this species remain limited. Microsatellite markers are considered to be a valuable tool for estimation of population diversity and structure. Availability of draft reference assembly of the Siberian larch genome allowed us to identify 1015 microsatellite loci or simple sequence repeats (SSRs) with tri-, tetra-, penta- and hexa-nucleotide motifs. For 60 of them PCR primers were designed and tested for amplification in L. sibirica and for their cross-genus transferability to L. gmelinii (Rupr.) Rupr. and L. cajanderi Mayr. Here we present a set of 14 reliable and polymorphic nuclear SSR markers that can be used for further population genetic studies, breeding programs and timber origin identification.

РИНЦ

Держатели документа:
Геттингенский университет им. Георга-Августа
Институт леса им. В.Н. Сукачева Сибирского отделения Российской академии наук : 660036, Красноярск, Академгородок, 50, стр. 28
Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук
Научно-образовательный центр геномных исследований Сибирского федерального университета
Техасский АМ университет, Колледж Стейшн

Доп.точки доступа:
Орешкова, Наталья Викторовна; Бондар, Е.И.; Bondar E.I.; Путинцева, Ю.А.; Putintseva Yu. A.; Шаров, В.В.; Sharov V.V.; Кузьмин, Д.А.; Kuzmin D.A.; Крутовский, К.В.; Krutovsky K.V.
575.174.015.3
Г 34

    Генетический полиморфизм сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour) в Кузнецком Алатау
[Текст] : статья / Наталья Викторовна Орешкова, Тамара Станиславовна Седельникова, Станислав Петрович Ефремов, Александр Владимирович Пименов // Сибирский экологический журнал. - 2020. - Т. 27, № 6. - С. 677-688 . - ISSN 0869-8619
УДК

Аннотация: Исследован полиморфизм ДНК семи ценопопуляций сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour), произрастающих в характерном для горно-таежных кедровников регионе - северо-восточной части Кузнецкого Алатау. По 11 ядерным микросателлитным локусам выявлено 44 аллельных варианта, существенно отличающихся у изученных ценопопуляций по составу и частотам встречаемости. Самый высокий уровень аллельного разнообразия имеют локусы Ps _80612, Ps _1502048, в которых выявлено 8 и 7 аллелей соответственно. Расчет основных параметров генетического разнообразия показал в целом сравнительно невысокий уровень полиморфизма исследованных выборок ( NA = 3,078; NE = 1,877; HE = 0,445; HO = 0,401). Анализ степени подразделенности ценопопуляций выявил, что внутри популяций сосредоточено около 95 % всего генетического разнообразия, тогда как на межпопуляционную составляющую приходится всего около 5 % (F ST = 0,049). Диагностированные различия в уровне генетического полиморфизма P. sibirica определяются: наличием между ценопопуляциями орографических и фитоценотических барьеров, обусловливающих направления векторов распространения семян вдоль водотоков бассейнов рек, формирующих р. Чулым в восточном секторе Кузнецкого Алатау и р. Томь - в западном; значительным уровнем биоклиматической и экологической экстремальности местопроизрастаний ценопопуляций в соответствии с высотой над уровнем моря; антропогенной нагрузкой, включающей периодические рубки и рекреационное воздействие на расположенные вблизи населенных пунктов ценопопуляции. Данные факторы, имеющие выраженную микроэволюционную составляющую, детерминируют адаптивные тренды ценопопуляций P. sibirica, морфологическое своеобразие и репродуктивный потенциал деревьев и, в конечном счете, контролируют их генетический полиморфизм в исследованной части Кузнецкого Алатау.
The DNA polymorphism of 7 coenopopulations of Siberian stone pine ( Pinus sibirica Du Tour), growing in the region which is typical for mountain taiga pine forests - the north-eastern part of the Kuznetsk Alatau, was studied. According to the data of 11 nuclear microsatellite loci, 44 allelic variants, which significantly differed between the studied cenopopulations in composition and frequency of occurrence were identified. The highest level of allelic diversity is found in the Ps_80612, Ps_1502048 loci, in which 8 and 7 alleles were detected, respectively. The calculation of the main parameters of genetic diversity showed, on the whole, a relatively low level of polymorphism of the studied samples ( NA = 3,078; NE = 1,877; HE = 0,445; HO = 0,401). An analysis of the degree of subdivision of cenopopulations revealed that about 95 % of the total genetic diversity is concentrated within populations, while the interpopulation component accounts for only about 5 % ( FST = 0,049). The diagnosed differences in the level of P. sibirica genetic polymorphism are determined by several factors: the presence of orographic and phytocenotic barriers between the coenopopulations which defined the directions of seed propagation vectors along the watercourses of river basins that formed the Chulym river in the eastern sector of the Kuznetsk Alatau and Tom river in the western sector; a significant level of bioclimatic and environmental extremeness of habitats of coenopopulations in accordance with the height above sea level; anthropogenic pressure, including periodic deforestation and recreational impact on coenopopulations located near settlements. These factors, which have a significant microevolutionary component, determine the adaptation trends of cenopopulations of P. sibirica , morphological singularities and reproductive potential of trees and, ultimately, control their genetic polymorphism in the studied part of the Kuznetsk Alatau

РИНЦ

Держатели документа:
Институт леса им. В. Н. Сукачева СО РАН
Сибирский федеральный университет
ФИЦ КНЦ СО РАН

Доп.точки доступа:
Орешкова, Наталья Викторовна; Седельникова, Тамара Станиславовна; Ефремов, Станислав Петрович; Пименов, Александр Владимирович