Труды сотрудников ИВМ СО РАН

w10=
Найдено документов в текущей БД: 12
   Е022
   Г671

    Демон Дарвина: Идея оптимальности и естественный отбор
[Текст] : учебное пособие / А.Н. Горбань, Р.Г. Хлебопрос. - М. : Наука, 1988. - 208 с. : ил, табл. - (Проблемы науки и технического прогресса). - Библиогр: с.199-203. - Именн. и предм. указ.: с.204-208. - ISBN 5-020013901-7 : 0.80 р.
ББК Е22

Кл.слова (ненормированные):
биология -- математическое моделирование

Аннотация: Может ли математическое моделирование помочь в понимании биологической эволюции и какие из проблем теории эволюции доступны математическому анализу? Эта центральная проблема книги. Почему все разнообразие мира живого разбито на отдельные группировки - виды, разновидности и т.п.? Можно ли описать наследование, не "подглядывая в ответ", не используя результатов объяснения? Что вообще может считаться объяснением? Подробно и почти без формул рассматриваются эти и другие вопросы, разбирается много примеров, обсуждаются различные типы моделей и принципы моделирования. Для всех, кто интересуется современной биологией и проблемами моделирования, - от школьников старших классов и студентов до специалистов - биологов и математиков.

Полный текст

Держатели документа:
ИВМ СО РАН : 660036, Красноярск, Академгородок, 50, стр.44

Доп.точки доступа:
Хлебопрос, Рэм Григорьевич; Gorban A.N.
Экземпляры всего: 1
Фонд (1)
Свободны: Фонд (1)
   Е07
   Л242

    Статистические методы моделирования и принятия решений в развивающихся медико-биологических системах.
[Текст] : монография / А.В. Лапко, О.М. Новиков, Л.С. Поликарпов. - Новосибирск : "Наука", 1991. - 221 с. : ил, табл. - ISBN 5-02-029908-1 : 3.40 р.
Библиогр: 241 назв.
УДК

Кл.слова (ненормированные):
медицина -- биология

Аннотация: Монография посвящена проблемам комплексного исследования развивающихся медико-биологических систем при априорной неопределенности. Авторы анализируют результаты применения разработанных моделей и алгоритмов при изучении процессов формирования здоровья человека. Для их широкого использования в медицине прилагается пакет программ. Книга предназначена для специалистов в области использования математических методов и ЭВМ в медицине, биологии и здравоохранении, для аспирантов, студентов медицинских и технических вузов.


Доп.точки доступа:
Новиков, О.М.; Поликарпов, Л.С.
Экземпляры всего: 1
Фонд (1)
Свободны: Фонд (1)
   61/Ж86-371223
61/Ж86-371223 / Ж86-63360098/Библиотека Политехнического Института СФУ

    Технология нейросетевого решения прикладных классификационных задач в экологии, биологии и медицине
[] : дис. ... канд. техн. наук : 05.13.16 / Л. А. Жуков. - Красноярск, 2000. - 215 с. : ил. -
УДК



Доп.точки доступа:
Горбань, Александр Николаевич \конс.\ 63360098/Библиотека Политехнического Института СФУ
Свободных экз. нет
   А2001-15686
   З635

    Метод упругих карт для визуализации данных: алгоритмы, программное обеспечение и приложения в биоинформатике
[Текст] : Автореф. дис. на соиск. учен. степ. канд. техн. наук : 05.13.11 / А. Ю. Зиновьев. - Красноярск : [б. и.], 2001. - 26 с. : ил. - Библиогр.: с. 25-26. - Б. ц.
ГРНТИ
ББК Ес512


Свободных экз. нет

    Функциональные характеристики бактериопланктона в связи с его агрегированностью в водоемах разного типа
[Текст] : статья / Л.А. Щур, А.Д. Апонасенко, В.Н. Лопатин, Г.В. Макарская // Известия РАН, серия биология. - 2002. - Т.29 , №.5 . - С. 431-436.



Доп.точки доступа:
Апонасенко, Анатолий Дмитриевич; Aponasenko A.D.; Лопатин, Валерий Николаевич; Lopatin V.N.; Макарская, Галина Владимировна; Makarskaya G.V.; Schur L.A.
   А1998
   В934

    Непараметрические системы классификации в задачах исследования медико-биологических процессов
[Рукопись] : автореф. дис. на соиск. учен. степ. канд. техн. наук : 05.13.14 / Г.С. Высоцкая ; Д064.54.01, Красноярский государственный технический университет. - Красноярск, 1998. - 23 с. - Библиогр.: с. 22-23. -
ГРНТИ
ББК Р.с512 + Е.с512

Аннотация: Разработка эффективных систем обработки информации, на основе создания мощных банков данных, и возможность более свободного обмена информацией через сети приводит к многократному увеличению ее объемов. В этих условиях возрастает потребность создания математических средств и разработки программ для структуризации и анализа больших массивов данных с целью обнаружения скрытых закономерностей и представления их в удобном для человека виде. Несмотря на это большое количество информации все-таки остается не востребованной. Когда пользователь оперирует большой, постоянно увеличивающейся числовой информацией, важным средством исследования систем в условиях исходной неопределенности становятся методы классификации и распознавания образов. Они позволяют создать представление о структуре этих данных, дифференцируя и объединяя их в классы. Если в результате решения задачи классификации получены компактные группы, однородные по характерным признакам, то в дальнейшем анализе мы можем использовать такие группы, как структурные единицы. Классификация данных обеспечивает обход проблемы сложности и априорной неопределенности при моделировании систем позволяет получить более точные оценки и распространить полученные результаты на множества объектов. Актуальной для классификации и распознавания образов, особенно в области медицины, является также задача о сокращении объема и размерности обучающей выборки. В настоящее время с различных теоретических позиций разработано большое число способов решения задачи классификации и распознавания образов. Установлено, что трудоемкость сложных методов классификации пропорциональна квадрату объема выборки N, и в лучшем случае имеет порядок O(N ln N). Требуемый объем памяти зачастую также пропорционален квадрату объема выборки. Известны примеры программных реализаций методов классификации и распознавания в таких коммерческих пакетах, как ER DAS, STATGRAF, STATISTICA, IDRISI и др. Но, как правило, в этих пакетах используется метод k — ближайших соседей и аналогичные методы, основным достоинством, которых является относительно низкая трудоемкость. Из российских разработок наиболее популярны пакеты ОТЭКС и КВАЗАР. В то же время опыт работы в области классификации и распознавания образов показывает необходимость создания быстродействующих алгоритмов классификации, хорошо работающих не только в ситуации хорошо разделимых классов, но и тогда, когда границы между соответствующими классами «размыты». Работа выполнялась в рамках научной темы Института Вычислительного моделирования СО РАН «Создание теории многоуровневых непараметрических систем принятия решений» (1.13.5.3), грантов РФФИ N93 — 012 — 0486, N97 — 01 — 01043.

http://icm.krasn.ru/refextra.php?id=869,
Полный текст

Держатели документа:
ИВМ СО РАН : 660036, Красноярск, Академгородок, 50, стр.44

Доп.точки доступа:
Д064.54.01, Красноярский государственный технический университет (Красноярск). Диссертационный совет
Экземпляры всего: 2
СИФ (2)
Свободны: СИФ (2)

    Динамика развития енисейского зообентоса в нижнем бъефе Красноярской ГЭС
[Текст] : статья / А. В. Андрианова // Вестник Томского государственного университета. Биология. - 2013. - № 1(21). - С. 74-88


Полный текст на сайте журнала


Доп.точки доступа:
Andrianova A.V.

    Сезонная и межгодовая динамика фитопланктона реки Енисей в районе водозабора Гремячий лог
[Текст] : статья / Ю. А. Пономарева, Л. А. Щур // Биология внутренних вод. - 2014. - № 1. - С. 38DOI 10.7868/S0320965214010112 . -


РИНЦ


Доп.точки доступа:
Щур, Людмила Александровна

    Применение методов редукции для построения комплексной модели апоптотических путей
[Текст] : статья / Е. О. Кутумова [и др.] // Математическая биология и биоинформатика. - 2012. - Т. 7, № 2. - С. 572-588 . - ISSN 1994-6538
   Перевод заглавия: The Application of Model Reduction Methods to the Construction of the Composite Model of Apoptotic Pathways
Аннотация: В работе предлагается новый подход для объединения математических моделей биологических систем на основе их редукции. Данный подход описан на примере двух моделей апоптоза, рассматривающих про- и антиапоптотические (активация NF-?B) пути рецептора СD95.
We propose a new approach to composition of mathematical models of biological systems, based on their reduction. This approach has been tested on the example of two apoptosis models describing pro- and anti-apoptotic (activation of NF-?B) pathways of CD95.

РИНЦ

Держатели документа:
Институт вычислительного моделирования СО РАН
Institut Curie
Институт цитологии и генетики СО РАН
Конструкторско-технологический институт вычислительной техники СО РАН
ООО “Институт системной биологии”

Доп.точки доступа:
Кутумова, Елена Олеговна; Kutumova Elena O.; Зиновьев, Андрей Юрьевич; Zinovyev A.Y.; Шарипов, Руслан Нильевич; Sharipov Ruslan N.; Колпаков, Федор Анатольевич; Kolpakov Fedor A.

    Symmetry of Siberian Larch Transcriptome
[Text] : статья / Michael G. Sadovsky [et al.] // Журнал Сибирского федерального университета. Серия: Биология. - 2015. - Т. 8, № 3. - P278-286, DOI 10.17516/1997-1389-2015-8-3-278-286 . - ISSN 1997-1389
   Перевод заглавия: Симметрия транскриптома сибирской лиственницы
УДК

Аннотация: The paper presents a novel approach to infer a structuredness in a set of symbol sequences such as transcriptome nucleotide sequences. A distribution pattern of triplet frequencies in the Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) transcriptome sequences was investigated in the presented study. It was found that the larch transcriptome demonstrates a number of unexpected symmetries in the statistical and combinatorial properties.
Проанализированы структуры, выделяемые в транскриптоме лиственницы. Показано, что данный набор последовательностей обладает необычной симметрией своих статистических и комбинаторных свойств.

РИНЦ

Держатели документа:
Georg-August-University of Gottingen
Institute of Computational Modelling SB RAS
M University HFSB
N. I. Vavilov Institute of General Genetics RAS
Siberian Federal University Genome Research and Education Centre
Texas A&amp
V. N. Sukachev Institute of Forest SB RAS

Доп.точки доступа:
Sadovsky, M.G.; Садовский, Михаил Георгиевич; Birukov, Vladislav V.; Бирюков В.В.; Putintseva, Yuliya A.; Путинцева Ю.А.; Oreshkova, Nataliya V.; Орешкова Н.В.; Vaganov, Eugene A.; Ваганов Е.А.; Krutovsky, Konstantin V.; Крутовский К.В.

    Seven-Cluster Structure of Larch Chloroplast Genome
[Text] : статья / M. G. Sadovsky [et al.] // Журнал Сибирского федерального университета. Серия: Биология. - 2015. - Т. 8, № 3. - P268-277, DOI 10.17516/1997-1389-2015-8-3-268-277. . - ISSN 1997-1389
   Перевод заглавия: Семикластерная структура генома хлоропласта лиственницы
УДК

Кл.слова (ненормированные):
Chloroplast genome -- complexity -- frequency dictionary -- order -- phase -- triplet -- сложность -- частотный словарь -- порядок -- фаза -- триплет

Аннотация: The paper presents a novel approach to study a nucleotide sequence structure with respect to the chloroplast genome DNA sequence analysis. A speci?c frequencies distribution pattern of the consecutive triple nucleotide fragments was identi?ed in the chloroplast genome DNA sequence, which demonstrated a non-degenerated pattern with seven clusters.
Проанализированы структуры, выделяемые в нуклеотидных последовательностях с помощью анализа распределений фрагментов генома. Показано, что последовательность генома хлоропласта обладает невырожденной семикластерной структурой в распределении таких фрагментов по частотам триплетов.

РИНЦ

Держатели документа:
Georg-August-University of Gottingen
Institute of Computational Modelling SB RAS
M University HFSB
N. I. Vavilov Institute of General Genetics RAS
Siberian Federal University Genome Research and Education Centre
Texas A&amp
V. N. Sukachev Institute of Forest SB RAS

Доп.точки доступа:
Sadovsky, M.G.; Садовский, Михаил Георгиевич; Bondar, Eugenia I.; Бондар Е.И.; Putintseva, Yulia A.; Путинцева Ю.А.; Oreshkova, Natalia V.; Орешкова Н.В.; Vaganov, Eugene A.; Ваганов Е.А.; Krutovsky, Konstantin V.; Крутовский К.В.

    Временная динамика структурных и функциональных характеристик енисейского фитопланктона в нижнем бьефе Красноярской ГЭС
[Текст] : научное издание / Юлия Андреевна Пономарева, Полина Владимировна Постникова // Вестник Томского государственного университета. Биология. - 2017. - № 38. - С. 167-182, DOI 10.17223/19988591/38/10 . - ISSN 1998-8591
   Перевод заглавия: Temporal dynamics of structural and functional characteristics of the Yenisei river phytoplankton downstream of the Krasnoyarsk hydroelectric power station
Аннотация: Представлены результаты изучения формирования фитопланктонного сообщества и флуоресцентных характеристик вод в условиях сброса высоконапорной Красноярской ГЭС. Сезонные и межгодовые изменения фитопланктона оценивали на основе численности и биомассы клеток фитопланктона, а также концентрации хлорофилла а. Выявлены закономерности сезонных сукцессий и межгодовых вариаций структурно-функциональных характеристик фитопланктона. Обнаружено, что основу флористического списка в реке Енисей составляют диатомовые водоросли (66% от общего видового состава), преобладающие в планктоне во все сезоны года. Наибольший вклад в общую численность и биомассу фитопланктона вносят нанофитопланктон (2-20 мкм) и микрофитопланктон (20-64 мкм). В комплекс доминантов вранневесенний период входили Diatoma vulgare Bory и Hannaea arcus (Ehrb.) Patr., в летний - Aulacoseira islandica (O. Mull.) Sim. и Cyclotella radiosa (Grun.) Lemm., позднелетний - Fragilaria crotonensis Kitt. Вместе с тем на фоне увеличивающегося видового разнообразия и интенсивного развития водорослей в весенне-летний период отмечен спад концентрации хлорофилла а. Установлено, что во все рассматриваемые годы пики численности и биомассы фитопланктона приходятся на июнь за счет колониальных диатомовых водорослей, попадающих в нижний бьеф со стоком из верхнего бьефа.
The Yenisei River is the biggest waterway in Siberia. In the second half of the 20th century, the Yenisei River was overlapped by dams, and it deeply damaged the natural hydrological, hydrochemical and hydrobiological regimes of the river. As a result of constructing the Krasnoyarsk hydroelectric power station, a significant river component - phytoplankton, which occupies the central place in the formation of the aquatic ecosystem - has changed downstream of the river. In the river, phytoplankton is formed from phytoperiphyton and allochthonous algae, including phytoplankton species of upstream reservoirs. Therefore, knowledge of transformation laws of phytoplankton species composition, which occurs during the regulation of the river flow and formation of reservoirs, may contribute to the development of ideas about changing the aquatic communities. The aim of this research was to explore the formation of phytoplankton under the conditions of water discharge in the Krasnoyarsk HPS and to study chlorophyll a concentration. We collected phytoplankton samples at a distance of 34 km below the Krasnoyarsk HPS (55°59'1.8"N, 92°47'13.4"E) in 2008-2014 and analyzed them according standard hydrobiological methods (See Table). In 2012-2014, we measured fluorescent water characteristics along with the study of algae. We took the nomenclature for algae considering taxonomic transformations according to the system adopted by the International algae database (http://www.algaebase.org). A quantitative processing of phytoplankton samples was conducted daily, species composition and biomass of algae was determined weekly. In size, algae cells were differentiated according to Rainey. The degree of complexity of phytoplankton communities was determined calculating the Shannon species diversity index (by biomass). The dominant algae included species making the main contribution into the total phytoplankton biomass. In 20122014, along with the study of algae, we determined chlorophyll а concentration by fluorimetric method, weekly (See Fig. 3). We collected and processed a total of 2453 qualitative and quantitative phytoplankton samples for the period of study; 89 samples to determine chlorophyll а content. Altogether, we found 99 species, kinds and forms of algae from 6 groups in the river phytoplankton. In the Yenisei River, diatoms, which predominate in plankton in all seasons, are characterized by the maximum number of species. There is a certain sequence in the appearance of dominant algae. From late April to late May, Diatoma vulgare Bory and Hannaea arcus (Ehrb.) Patr. were recorded in quantities, in June -Aulacoseira islandica (O. Mull.) Sim., in July - Cyclotella radiosa (Grun.) Lemm., in August - Fragilaria crotonensis Kitt. (See Fig. 1). Upstream of the Krasnoyarsk reservoir A. islandica had a dominant position in nephotic cold layer in June, in July and August - C. radiosa; F. crotonensis was a subdominant. It is known that deep water discharge through the dam (18-40 м) is specific for the Krasnoyarsk reservoir. This causes the flow of algae over the dam. In general, the dynamics of the total number and the total biomass of phytoplankton had the form of unimodal curve within the year (with a peak in June) (See Fig. 2). Nanophytoplankton (2-20 mkm) and microphytoplankton (20-64 mkm) made the biggest contribution to the total biomass of phytoplankton. We recorded peaks of number and biomass of phytoplankton in June in all years in question. We found that the percentage of chlorophyll content per phytoplankton biomass unit had seasonal variations and increased in winter (See Fig. 5). It is known, that the concentration of chlorophyll a depends on dimensional structure of phytoplankton. In spring and summer, the domination of algae cells with bigger volumes in phytoplankton caused a decrease in chlorophyll а concentration.

РИНЦ

Держатели документа:
Институт вычислительного моделирования СО РАН

Доп.точки доступа:
Пономарева, Юлия Андреевна; Ponomareva Yulia A.; Постникова, Полина Владимировна; Postnikova Polina V.