Библиотека института физики им. Л.В. Киренского СО РАН

Главная

Базы данных

Труды сотрудников ИФ СО РАН - результаты поиска

Вид поиска

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН

Каталог журналов библиотеки ИФ СО РАН

Труды сотрудников ИФ СО РАН

Область поиска

Найдено в других БД:

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН (2)

Формат представления найденных документов:
полный	информационный	краткий

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Артюшенко, Полина Владимировна$<.>)

Общее количество найденных документов : 14
Показаны документы с 1 по 14

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Artyushenko P. V., Tomilin F. N., Kuzubov A. A., Ovchinnikov S. G., Tsikalova P. E., Ovchinnikova T. M., Soukhovolsky V. G.
Заглавие : Action of the atomic and electronic structure of pheromone molecules on the effectiveness of communication in xylophagous insects
Коллективы : RFBR [13-04-00375, 16-04-00132]
Место публикации : J. Struct. Chem.: MAIK Nauka-Interperiodica / Springer, 2016. - Vol. 57, Is. 2. - P.287-293. - ISSN 0022-4766, DOI 10.1134/S0022476616020074. - ISSN 1573-8779(eISSN)
Примечания : Cited References:27. - This work was supported by RFBR projects Nos. 13-04-00375 and16-04-00132.
Предметные рубрики: Monochamus-galloprovincialis coleoptera
Density-functional theories
Beetle Ips-typographus
Pine sawyer beetle
Aggregation pheromone
Cerambycidae
Attraction
Components
Attack
Set
Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): atomic and electronic structure--functional density methods--absorption--spectra--excited states--xylophages--pheromones
Аннотация: The B3LYD /6-31(p,d) density functional method is applied to pheromones of the forest xylophagous insects Ips typographus L., Monochamus urussovi Fisch., and Monochamus galloprovincialis Oliv. to calculate the absorption spectra and find excited states. The calculated results are used to assess the possible activity of the molecules when they are affected by solar radiation.
Смотреть статью,
Scopus,
WOS,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Ovchinnikov S. G., Tomilin F. N., Artushenko P. V., Sukhovol'sky V., Ovchinnikova T. M., Volkova, Palina, Baranchikov Y. N., Vysotskii E. S.
Заглавие : Quantum chemical modeling in the molecular ecology
Место публикации : Models of the ecological hierarchy: From molecules to the ecosphere/ ed.: F. Jordán, S. E. Jørgensen: Elsevier, 2012. - P.3-13. - (Developments in environmental modelling; Vol. 25). - ISSN 0167-8892, DOI 10.1016/B978-0-444-59396-2.00001-8. - ISSN 978-0-444-59396-2
Примечания : Cited References: 14
Аннотация: Quantum chemical modeling of the electronic structure and evaluation of the total energy of several biological molecules important for the ecology have been carried out. The first example is represented by pheromone molecules of the gypsy moth and the Siberian silk moth and their responses to substances present in the forest and to electromagnetic radiation. The second example is concerned with the molecular mechanism of bioluminescence. Here we report the quantum chemical modeling of the excited states of coelenteramide embedded in the active site of the protein. We demonstrate that the fluorescence wavelength extremely depends on the proton position between coelenteramide and histidine.
Смотреть статью,
Scopus
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Mironov, Vladimir, Shchugoreva I. A., Artyushenko P. V., Morozov D. I., Borbone N., Oliviero G., Zamay T. N., Moryachkov R. V., Kolovskaya, ., Lukyanenko K. A., Song Y. L., Merkuleva I. A., Zabluda V. N., Peters G., Koroleva L. S., Veprintsev D. V., Glazyrin Y. E., Volosnikova E. A., Belenkaya S. V., Esina T. I., Isaeva A. A., Nesmeyanova, ., Shanshin D. V., Berlina A. N., Komova N. S., Svetlichnyi V. A., Silnikov V. N., Shcherbakov D. N., Zamay G. S., Zamay S. S., Smolyarova T. E., Tikhonova E. P., Chen U. S., Jeng G., Condorelli V., Franciscis G., Groenhof C. Y., Yang A. A., Moskovsky D. G., Fedorov F. N., Tomilin F. N., Tan Y., Alexeev M. V., Berezovski A. S., Kichkailo A.S.
Заглавие : Structure- and interaction-based design of anti-SARS-CoV-2 Aptamers
Коллективы : Aptamerlab LCC; U.S. Department of Energy, Office of ScienceUnited States Department of Energy (DOE) [DE-AC02-06CH11357]; European UnionEuropean Commission [H2020-INFRAEDI-02-2018-823830, H2020-EINFRA-2015-1-675728, 872391, PRISAR2 872860]; CSC-IT center in Espoo, Finland; PRACE; Russian Foundation for Basic ResearchRussian Foundation for Basic Research (RFBR) [19-03-00043]; Ministry of Science and Higher Education of Russian Federation (state assignment of the Research Center of Biotechnology RAS); Italian Ministry of Education and ResearchMinistry of Education, Universities and Research (MIUR) [FISR2020 _00177]; Canadian Institutes of Health ResearchCanadian Institutes of Health Research (CIHR) [OV1-170353]; Russian Science FoundationRussian Science Foundation (RSF) [21-73-20240]
Место публикации : Chem. - Eur. J. - 2022. - Vol. 28, Is. 12. - Ст.e202104481. - ISSN 0947-6539, DOI 10.1002/chem.202104481. - ISSN 1521-3765(eISSN)
Примечания : Cited References: 85. - The authors are grateful to JCSS Joint Super Computer Center of the Russian Academy of Sciences – Branch of Federal State Institution “Scientific Research Institute for System Analysis of the Russian Academy of Sciences” for providing supercomputers for computer simulations. The authors thank the RSC Group (www.rscgroup.ru) and personally Mr. Oleg Gorbachev for the constant support and establishment of “The Good Hope Net Project” (www.thegoodhope.net) multifunctional non-profit anti-CoVID research project. The authors also thank the Helicon Company (www.helicon.ru) and personally Olesya Kucenko, Alexander Kolobov, Leonid Klimov for instrumental support and help with conducting fluorescence polarization assays, which were performed on a demo instrument Clariostar Plus microplate reader (BMG LABTECH, Germany). We thank Dr. Yong-Zhen Zhang for providing the genome sequence of 2019-nCoV and Dr. Xinquan Wang for providing the crystal structure of the binding domain of the SARS-2 Spike protein. The authors are grateful to Aptamerlab LCC financial support (www.aptamerlab.com). Y.A.’s work at Argonne National Laboratory was supported by the U.S. Department of Energy, Office of Science, under contract DE-AC02-06CH11357. The work of D.M. and G.G. has been done as part of the BioExcel CoE (www.bioexcel.eu), a project funded by the European Union contracts H2020-INFRAEDI-02-2018-823830 and H2020-EINFRA-2015-1-675728. D.M. and G.G. also thank the CSC-IT center in Espoo, Finland, as well as PRACE for awarding access to resource Curie-Rome based in France at GENCI. V.M. thanks Russian Foundation for Basic Research (project number 19-03-00043). A.B.’s and N.K.’s work was supported by the Ministry of Science and Higher Education of Russian Federation (state assignment of the Research Center of Biotechnology RAS). V. deF. G.C., N.B and G.O. are grateful to FISR2020 _00177 Shield, Italian Ministry of Education and Research, for funding. GC is grateful to the European Union's Horizon 2020 research and innovation program under the Marie Skłodowska-Curie grant agreement: cONCReTE 872391; PRISAR2 872860. Use of the 13 A BioSAXS beamtime at the Taiwan Photon Source is acknowledged. The work of M.V.B was funded by the Canadian Institutes of Health Research grant OV1-170353. SAXS measurements and PIEDA analyses were funded by the Russian Science Foundation (project No 21-73-20240 for A.S.K.)
Предметные рубрики: BIOLOGICAL MACROMOLECULES
SOLUTION SCATTERING
BINDING
SPIKE
Аннотация: Aptamer selection against novel infections is a complicated and time-consuming approach. Synergy can be achieved by using computational methods together with experimental procedures. This study aims to develop a reliable methodology for a rational aptamer in silico et vitro design. The new approach combines multiple steps: (1) Molecular design, based on screening in a DNA aptamer library and directed mutagenesis to fit the protein tertiary structure; (2) 3D molecular modeling of the target; (3) Molecular docking of an aptamer with the protein; (4) Molecular dynamics (MD) simulations of the complexes; (5) Quantum-mechanical (QM) evaluation of the interactions between aptamer and target with further analysis; (6) Experimental verification at each cycle for structure and binding affinity by using small-angle X-ray scattering, cytometry, and fluorescence polarization. By using a new iterative design procedure, structure- and interaction-based drug design (SIBDD), a highly specific aptamer to the receptor-binding domain of the SARS-CoV-2 spike protein, was developed and validated. The SIBDD approach enhances speed of the high-affinity aptamers development from scratch, using a target protein structure. The method could be used to improve existing aptamers for stronger binding. This approach brings to an advanced level the development of novel affinity probes, functional nucleic acids. It offers a blueprint for the straightforward design of targeting molecules for new pathogen agents and emerging variants.
Смотреть статью,
Scopus,
WOS
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Moryachkov R. V., Morozov D., Mironov V., Shchugoreva I., Artyushenko P. V., Zamay G. S., Molodenskiy D. S., Zabluda V. N., Kichkailo A.S., Sokolov A. Е.
Заглавие : The role of small-angle X-ray scattering and molecular simulations in 3D structure elucidation of a DNA aptamer-cancer cells magnetic separation agent
Коллективы : International Baltic Conference on Magnetism: focus on nanobiomedicine and smart materials, Балтийский федеральный университет им. И. Канта
Место публикации : 4th International Baltic Conference on Magnetism (IBCM 2021): Book of abstracts. - 2021. - P.168
Примечания : Cited References: 2. - The reported study was funded by RFBR, project number 19-32-90266
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Однотомное издание
Шифр издания : Г5/А 86 рукописный текст
Автор(ы) : Артюшенко, Полина Владимировна
Заглавие : Атомная и электронная структуры феромонов в основном и возбуждённом состояниях : дис. на соиск. уч. степени канд. физ.-мат. наук : 01.04.07
Выходные данные : Красноярск, 2019
Колич.характеристики :100 с
Коллективы : Институт физики им. Л.В. Киренского Сибирского отделения РАН
Примечания : Библиогр.: 97 назв.
ГРНТИ : 31.15.15 + 29.19.24 + 31.21.15
ББК : Г511.2я031
Экземпляры :ДС(1)
Свободны : ДС(1)
Смотреть диссертацию
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Артюшенко, Полина Владимировна, Томилин, Феликс Николаевич, Кузубов, Александр Александрович, Овчинников, Сергей Геннадьевич, Цикалова, Полина Сергеевна, Овчинникова Т. М., Суховольский, Владислав Григорьевич
Заглавие : Влияние атомной и электронной структуры молекул феромонов на эффективность коммуникации насекомых-ксилофагов
Место публикации : Журн. структ. химии. - 2016. - Т. 57, № 2. - С. 304-310. - ISSN 0136-7463, DOI 10.15372/JSC20160207
Примечания : Библиогр.: 27. - Работа поддержана Российским фондом фундаментальных исследований (грант № 13-04-00357 и № 16-04-00132А).Авторы благодарят за помощь сотрудников межведомственного суперкомпьютерного центра РАН МВС-100К и комплекса высокопроизводительных вычислений ИКИТ СФУ
Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): атомная и электронная структура--методы функционала плотности--спектры поглощения--возбужденные состояния--ксилофаги--феромоны
Аннотация: Для феромонов лесных насекомых-ксилофагов Ips typographus L., Monochamus urussovi Fisch. и Monochamus galloprovincialis Oliv. с помощью метода функционала плотности B3LYР/6-31(p,d) были рассчитаны спектры поглощения и найдены возбужденные состояния. На основании расчетов оценивается возможная активность молекул при воздействии на них солнечной радиации.
Смотреть статью,
РИНЦ,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Артюшенко, Полина Владимировна, Томилин, Феликс Николаевич
Заглавие : Влияние структуры феромонных молекул на эффективность канала феромонной коммуникации насекомых
Коллективы : "Сложные системы в экстремальных условиях", Всероссийский симпозиум с международным участием, Федеральный исследовательский центр "Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук", Сибирский федеральный университет
Место публикации : Сложные системы в экстремальных условиях: материалы XIX Всерос. симп. с междунар. участием, посв. памяти Р. Г. Хлебопроса. - 2018. - С. 19-22. - ISBN 978-5-6041286-8-8 (Шифр 35472960)
РИНЦ,
Материалы конференции
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Томилин, Феликс Николаевич, Артюшенко, Полина Владимировна, Овчинников, Сергей Геннадьевич, Цикалова, Полина Сергеевна, Овчинникова Т. М., Суховольский, Владислав Григорьевич
Заглавие : Влияние электронной структуры молекул феромонов на эффективность коммуникации насекомых-ксилофагов
Коллективы : "Физика - наукам о жизни", Российская конференция, "Физика - наукам о жизни", школа молодых ученых, Физико-технический институт им. А.Ф. Иоффе РАН
Место публикации : Первая Рос. конф. "Физика - наукам о жизни": 978-5-93634-034-5. - СПб., 2016. - Ст.Пн-1.24с (Rep_0092). - С. 70
Примечания : Работа поддержана РФФИ (грант № 16-04-00132а)
Материалы конференции
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Морячков, Роман Владимирович, Заблуда, Владимир Николаевич, Щугорева, Ирина Андреевна, Артюшенко, Полина Владимировна, Кичкайло, Анна Сергеевна, Спиридонова В. А., Берлина А. Н., Соколов, Алексей Эдуардович
Заглавие : Исследование пространственной структуры бионаноконъюгатов на основе ДНК-аптамеров синхротронными методами
Коллективы : Сибирский семинар по высокотемпературной сверхпроводимости и физике наноструктур, Институт неорганической химии им. А.В. Николаева Сибирского отделения РАН, Новосибирский государственный университет, Новосибирский государственный технический университет, Сибирский федеральный университет, Институт физики им. Л.В. Киренского Сибирского отделения РАН, Омский государственный университет им. Ф.М. Достоевского, Научный совет РАН по физике низких температур
Место публикации : XIII Cибирский семинар по высокотемпературной сверхпроводимости и физике наноструктур (ОКНО-2021): сб. тезисов докладов/ сопредс., чл. прогр. ком. С. Г. Овчинников и др. - 2021. - С. 50. - ISBN 978-5-90168-835-9
Примечания : Библиогр.: 1
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

10.

Вид документа : Статья из сборника (том многотомника)
Шифр издания :
Автор(ы) : Щугорева, Ирина Андреевна, Рогова А. В., Артюшенко, Полина Владимировна, Томилин, Феликс Николаевич
Заглавие : Квантовохимическое исследование структуры и оптических свойств фотоактивных полимеров
Коллективы : Сибирский федеральный университет, Российская академия наук, Сибирское отделение РАН, Федеральный исследовательский центр "Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук", Институт физики им. Л.В. Киренского Сибирского отделения РАН, Всероссийская научная конференция с международным участием "Енисейская фотоника-2022", "Енисейская фотоника", Всероссийская научная конференция с международным участием
Место публикации : Енисейская фотоника-2022: тезисы докладов : в 2-х т./ Сиб. федер. ун-т [и др.]. - Красноярск, 2022. - Т. 1, Секция 1: Новые оптические материалы. - С. 107. - ISBN 978-5-6045250-1-2
Примечания : Библиогр.: 2
Аннотация: Светоизлучающие полимеры, под воздействием тока невысокого напряжения, дающие различные цвета, представляют научный интерес в связи с производством светоизлучающих диодов, источников освещения, информационных панелей. В данной работе было проведено исследование влияния пути сопряжения и различных заместителей в сополимерах с антразолиновыми звеном на оптические свойства полимера.
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

11.

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Кузубов, Александр Александрович, Аврамов, Роман Павлович, Раимова М.А., Попов М. Н., Милютина Ю.М., Кожевникова Т.А., Артюшенко, Полина Владимировна
Заглавие : Моделирование и расчет физико-химических параметров процесса диффузии атомарного водорода на поверхности нанотруб различного размера и хиральности
Место публикации : Журнал физической химии. - 2009. - Т. 83, № 4. - С. 753-757. - ISSN 0044-4537
Аннотация: Работа посвящена моделированию процесса диффузии атомарного водорода на поверхности углеродных нанотруб, отличающихся размером и хиральностью. Расчеты основаны на оценке энергии активации методом функционала плотности и применении теории переходного состояния.
РИНЦ,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

12.

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Шустин, Максим Сергеевич, Морячков, Роман Владимирович, Заблуда, Владимир Николаевич, Щугорева, Ирина Андреевна, Артюшенко, Полина Владимировна, Кичкайло, Анна Сергеевна, Спиридонова В. А., Берлина А. Н., Соколов, Алексей Эдуардович
Заглавие : Низкоэнергетическая модель спин-поляризованной сверхпроводящей нанопроволоки в режиме сильных электронных корреляций
Коллективы : Сибирский семинар по высокотемпературной сверхпроводимости и физике наноструктур, Институт неорганической химии им. А.В. Николаева Сибирского отделения РАН, Новосибирский государственный университет, Новосибирский государственный технический университет, Сибирский федеральный университет, Институт физики им. Л.В. Киренского Сибирского отделения РАН, Омский государственный университет им. Ф.М. Достоевского, Научный совет РАН по физике низких температур
Место публикации : XIII Cибирский семинар по высокотемпературной сверхпроводимости и физике наноструктур (ОКНО-2021): сб. тезисов докладов/ сопредс., чл. прогр. ком. С. Г. Овчинников и др. - 2021. - С. 49. - ISBN 978-5-90168-835-9
Примечания : Библиогр.: 4. - Работа выполнена при поддержке РФФИ (проект No 19-02-00348), Правительства Красноярского края, Красноярского краевого фонда науки в рамках научного проекта «Спиновые флуктуации и магнитный порядок в проблеме реализации майорановских мод в низкоразмерных системах» (No 20-42-243001)
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

13.

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Артюшенко, Полина Владимировна, Томилин, Феликс Николаевич, Кузубов, Александр Александрович, Овчинников, Сергей Геннадьевич, Цикалова, Полина Евгеньевна, Овчинникова Т. М., Суховольский, Владислав Григорьевич
Заглавие : Устойчивость феромонов насекомых-ксилофагов к факторам внешней cpеды: оценка на основе квантово -химического анализа
Место публикации : Биофизика: Наука, 2017. - Т. 62, № 4. - С. 657-664. - ISSN 0006-3029
Примечания : Библиогр.: 50
Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): насекомые--ксилофаги--феромоны--молекулы--химические свойства--природная среда--влияние--информация--поиск--эффективность
Аннотация: Молекулы феромонов ряда лесных насекомых-ксилофагов (короеда-типографа typographыs L., черного пихтового усача Monochamыs urussovi Fisdi. и черного соснового усача Monochamыs galloprovincialis Oliv.) были рассчитаны в основном и возбужденном состоянии с помощью квантово-химического метода DFT B3LYP. Были определены длины волн (энергии) поглощения молекул, значение дипольного момента, рассмотрены пеpеxоды электронов с занятых молекулярный орбиталей на вакантные. На основании полученный расчетный данный оценена устойчивость молекул феромонов к действию таких факторов, как солнечное излучение и влажность.
РИНЦ,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

14.

Вид документа : Однотомное издание
Шифр издания :
Автор(ы) : Суховольский, Владислав Григорьевич, Артюшенко, Полина Владимировна, Томилин, Феликс Николаевич, Цикалова, Полина Евгеньевна, Ковалёв, Антон Владимирович
Заглавие : Феромоны лесных насекомых: системный и квантовохимический анализ
Выходные данные : М.: Т-во науч. изданий КМК, 2021
Колич.характеристики :150 с.: ил.
Коллективы : Федеральный исследовательский центр "Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук", Институт леса им. В. Н. Сукачева Сибирского отделения РАН, Институт физики им. Л.В. Киренского Сибирского отделения РАН, Сибирский федеральный университет
Примечания : Прил.: с. 128-136 - Библиогр.: с. 137-149
ISBN, Цена 978-5-907372-66-5:
Аннотация: Монография посвящена анализу и моделирования системных свойств феромонной коммуникации лесных насекомых. Изучены закономерности структуры и соотношения концентраций различных компонентов феромонов, рассмотрены особенности поведения имаго насекомых, летящих в феромонных струях, предложены математические модели стимулированного феромонами полёта, рассматриваются стратегии феромонной коммуникации, обсуждаются требования к эффективности феромонного поиска. Оцениваются возможности учёта численности и управления поведением чешуекрылых с использованием феромонных ловушек. При изучении феромонной коммуникации проведение экспериментов с молекулами феромонов затруднено в связи со сложностями выделения молекул из тел особей и техническими сложностями экспериментов, отсутствием физических датчиков концентраций конкретных феромонов и т.п. Однако тот факт, что химический состав многих тысяч молекул феромонов известен, и эти молекулы состоят из достаточно малого числа атомов, открывает возможность изучения свойств молекул феромонов не экспериментальными методами, а методами теоретической квантовой химии. В настоящее время методы расчетов таких относительно небольших по молекулярному весу и простых по своей структуре молекул достаточно хорошо разработаны и в настоящей монографии эти методы использованы для расчетов свойств феромонов насекомых. Рассматриваются методы теоретического исследования структуры и квантово-химических свойств феромонов. Представлены расчеты квантово-химических свойств, модели атомной и электронной структуры феромоны ряда видов чешуекрылых и жесткокрылых насекомых. Дается оценка устойчивости феромонных молекул к световому термическому воздействию. Обсуждается эволюционные аспекты формирования структуры и свойств молекул феромонов, вводится понятие трансформированных феромонов (химер), рассматриваются: структура возможных молекул-химер и проводится расчёт квантово-химических свойств трансформированных феромонов пядениц. - Книга предназначена для экологов, энтомологов, физиков и биофизиков, специалистов по системному анализу и математическому моделированию экологических процессов, а также для аспирантов по этим специальностям.
Найти похожие