Библиотека института физики им. Л.В. Киренского СО РАН

Главная

Базы данных

Труды сотрудников ИФ СО РАН - результаты поиска

Вид поиска

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН

Каталог журналов библиотеки ИФ СО РАН

Труды сотрудников ИФ СО РАН

Область поиска

в найденном

Формат представления найденных документов:
полный	информационный	краткий

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Moryachkov, R. V.$<.>)

Общее количество найденных документов : 16
Показаны документы с 1 по 10

1-10 11-16

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Tomilin F. N., Moryachkov R. V., Shchugoreva I. A., Kaufman E., Drevolsky A., Sokolov A. Е.
Заглавие : Molecular structure restoration of aptamers by small angle X-ray scattering and computer simulation
Коллективы : Aptamers in Russia, international conference
Место публикации : Aptamers in Russia, international conference (1 ; 2019 ; Aug. 27-30 ; Krasnoyarsk). Molecular Therapy - Nucleic Acids: book of abstracts of the 1st Int. conf. "Aptamers in Russia 2019". - 2019. - Vol. 17, Suppl. 1. - P.4
Материалы конференции
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Moryachkov R. V., Zabluda V. N., Sokolov A. Е., Shchugoreva I. A., Tomilin F. N., Peters G., Spiridonova V. A.
Заглавие : Small-Angle scattering applications to the analysis of aptamer structure and conformational changes
Коллективы : Aptamers in Russia, international conference
Место публикации : Aptamers in Russia, international conference (1 ; 2019 ; Aug. 27-30 ; Krasnoyarsk). Molecular Therapy - Nucleic Acids: book of abstracts of the 1st Int. conf. "Aptamers in Russia 2019". - 2019. - Vol. 17, Suppl. 1. - P.4
Материалы конференции
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (выпуск продолж. издания)
Шифр издания :
Автор(ы) : Moryachkov R. V., Zabluda V. N., Berlina A. N., Peters G. S., Kichkailo A. S., Sokolov A. Е.
Заглавие : Small-angle scattering applications to the analysis of aptamer structure and conformational changes
Коллективы : Internetional Conference on Synchrotron and Free Electron Laser Radiation: Generation and Application
Место публикации : Internetional Conference on Synchrotron and Free Electron Laser Radiation: Generation and Application (2020 ; 13-16 July ; Novosibirsk). AIP Conference Proceedings: book of abstracts. - 2020. - Vol. 2299. - Ст.040002. - , DOI 10.1063/5.0030394; \b Synchrotron and free electron laser radiation: generation and application (SFR-2020). - Novosibirsk. - P.45-46
Примечания : Cited References: 40. - The reported study was funded by RFBR, project number 19-32-90266 (investigation of the structure changes). This work was financially supported by Russian Science Foundation (project # 19-44-02020, obtaining of the complexes of aptamer and lead ions). We acknowledge the European Synchrotron Radiation Facility for provision of synchrotron radiation facilities (experiment #MX-2039) and we would like to thank Bart Van Laer for assistance in using beamline BM29
Аннотация: Aptamers, structured single-chain oligonucleotides, are promising tools for detection of a wide variety of compounds, from high to low molecular weight, and affecting on them. The aptamers that are most affine for a detectable compound are selected from the libraries of random sequences by the SELEX method (Systematic evolution of ligands by exponential enrichment). The reason why aptamers deserve a special consideration lies in the specific features of their structure and the mechanism of binding to their target. Aptamers can be exploited for metal-ion sensing, biosensing, drug delivery and other functions. To apply the oligonucleotides in the medicine, ecology, food production, agriculture, etc., we need to know how the aptamers bind to their targets, how they change their conformation upon specific binding and how the environment influences on the affinity of aptamers. Small-Angle X-ray scattering showed that the interaction of aptamers with heavy metal and other divalent ions proceeds according to different mechanisms, and the aptamers used undergo different conformational changes.
Смотреть статью,
Scopus,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Moryachkov R. V., Berlina A. N., Artyushenko P. V., Zabluda V. N., Peters G. S., Sokolov A. Е.
Заглавие : Conformational changes in DNA aptamers upon binding to Pb ions
Коллективы : Asian School-Conference on Physics and Technology of Nanostructured Materials, Азиатская школа-конференция по физике и технологии наноструктурированных материалов
Место публикации : The Fifth Asian School-Conference on Physics and Technology of Nanostructured Materials: Proceedings. - VLadivostok: Dalnauka Publishing, 2020. - Ст.VII.31.01p. - P.193. - ISBN 978-5-8044-1698-1
Примечания : The reported study was funded by RFBR, project number 19-32-90266.
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Шустин, Максим Сергеевич, Морячков, Роман Владимирович, Заблуда, Владимир Николаевич, Щугорева, Ирина Андреевна, Артюшенко, Полина Владимировна, Кичкайло, Анна Сергеевна, Спиридонова В. А., Берлина А. Н., Соколов, Алексей Эдуардович
Заглавие : Низкоэнергетическая модель спин-поляризованной сверхпроводящей нанопроволоки в режиме сильных электронных корреляций
Коллективы : Сибирский семинар по высокотемпературной сверхпроводимости и физике наноструктур, Институт неорганической химии им. А.В. Николаева Сибирского отделения РАН, Новосибирский государственный университет, Новосибирский государственный технический университет, Сибирский федеральный университет, Институт физики им. Л.В. Киренского Сибирского отделения РАН, Омский государственный университет им. Ф.М. Достоевского, Научный совет РАН по физике низких температур
Место публикации : XIII Cибирский семинар по высокотемпературной сверхпроводимости и физике наноструктур (ОКНО-2021): сб. тезисов докладов/ сопредс., чл. прогр. ком. С. Г. Овчинников и др. - 2021. - С. 49. - ISBN 978-5-90168-835-9
Примечания : Библиогр.: 4. - Работа выполнена при поддержке РФФИ (проект No 19-02-00348), Правительства Красноярского края, Красноярского краевого фонда науки в рамках научного проекта «Спиновые флуктуации и магнитный порядок в проблеме реализации майорановских мод в низкоразмерных системах» (No 20-42-243001)
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Морячков, Роман Владимирович, Заблуда, Владимир Николаевич, Щугорева, Ирина Андреевна, Артюшенко, Полина Владимировна, Кичкайло, Анна Сергеевна, Спиридонова В. А., Берлина А. Н., Соколов, Алексей Эдуардович
Заглавие : Исследование пространственной структуры бионаноконъюгатов на основе ДНК-аптамеров синхротронными методами
Коллективы : Сибирский семинар по высокотемпературной сверхпроводимости и физике наноструктур, Институт неорганической химии им. А.В. Николаева Сибирского отделения РАН, Новосибирский государственный университет, Новосибирский государственный технический университет, Сибирский федеральный университет, Институт физики им. Л.В. Киренского Сибирского отделения РАН, Омский государственный университет им. Ф.М. Достоевского, Научный совет РАН по физике низких температур
Место публикации : XIII Cибирский семинар по высокотемпературной сверхпроводимости и физике наноструктур (ОКНО-2021): сб. тезисов докладов/ сопредс., чл. прогр. ком. С. Г. Овчинников и др. - 2021. - С. 50. - ISBN 978-5-90168-835-9
Примечания : Библиогр.: 1
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Moryachkov R. V., Zabluda V. N., Shchugoreva, Irina A., Artyushenko P. V., Kichkaylo A.S., Spiridonova V. A., Berlina A. N., Sokolov A. Е.
Заглавие : Investigation of the spatial structure of bionanoconjugates based on DNA aptamers by synchrotron methods
Коллективы : "Functional materials", International conference, Крымский федеральный университет имени В.И. Вернадского
Место публикации : Ovchinnikov S. G. International conference "Functional materials": book of abstracts/ ed. V. N. Berzhansky ; org. com. S. G. Ovchinnikov [et al.]. - Simferopol, 2021. - P.310
Примечания : Библиогр.: 3 назв. - The research was carried out with a grant from the Russian Science Foundation № 21-12-00226, https://rscf.ru/project/21-12-00226/
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Ozerskaya A. V., Zamay T. N., Kolovskaya O. S., Tokarev N. A., Belugin K. V., Chanchikova N. G., Badmaev O. N., Zamay G. S., Shchugoreva I. A., Moryachkov R. V., Zabluda V. N., Khorzhevskii V. A., Shepelevich N., Gappoev S. V., Karlova E. A., Saveleva A. S., Volzhentsev A. A., Blagodatova A. N., Lukyanenko K. A., Veprintsev D. V., Smolyarova T. E., Tomilin F. N., Zamay S. S., Silnikov V. N., Berezovski M. V., Kichkailo A. S.
Заглавие : 11C-radiolabeled aptamer for imaging of tumors and metastases using positron emission tomography-computed tomography
Место публикации : Mol. Ther. Nucl. Acids. - 2021. - Vol. 26. - P.1159-1172. - ISSN 21622531 (ISSN), DOI 10.1016/j.omtn.2021.10.020
Примечания : Cited References: 44
Аннотация: Identification of primary tumors and metastasis sites is an essential step in cancer diagnostics and the following treatment. Positron emission tomography-computed tomography (PET/CT) is one of the most reliable methods for scanning the whole organism for malignancies. In this work, we synthesized an 11C-labeled oligonucleotide primer and hybridized it to an anti-cancer DNA aptamer. The 11C-aptamer was applied for in vivo imaging of Ehrlich ascites carcinoma and its metastases in mice using PET/CT. The imaging experiments with the 11C-aptamer determined very small primary and secondary tumors of 3 mm2 and less. We also compared 11C imaging with the standard radiotracer, 2-deoxy-2-[fluorine-18]fluoro-D-glucose (18F-FDG), and found better selectivity of the 11C-aptamer to metastatic lesions in the metabolically active organs than 18F-FDG. 11C radionuclide with an ultra-short (20.38 min) half-life is considered safest for PET/CT imaging and does not cause false-positive results in heart imaging. Its combination with aptamers gives us high-specificity and high-contrast imaging of cancer cells and can be applied for PET/CT-guided drug delivery in cancer therapies.
Смотреть статью,
Scopus,
WOS,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Shchugoreva I. A., Artyushenko P. V., Tomilin F. N., Morozov D. I., Mironov V. A., Moryachkov R. V., Kichkailo A. S.
Заглавие : Applying joint theoretical experimental research to aptamer modeling
Место публикации : Sib. Med. Rev. - 2021. - Vol. 2021, Is. 2. - P.105-106. - ISSN 18199496 (ISSN), DOI 10.20333/2500136-2021-2-105-106; Сиб. мед. обозрение
Примечания : Cited References: 4
Аннотация: The aim of the research. In this work we studied the structure of LC-18 DNA aptamer, which exhibits specific binding to lung adenocarcinoma cells. Obtain-ing the 3D structure of the aptamer is necessary for understanding the mechanism of binding of the aptamer to the target. Therefore, the aim of the research was modeling of the LC-18 aptamer spatial structure using combination of theoretical methods: DNA folding tools, quantum-chemical calculations and molecular dynamic simulations. Material and methods. The secondary structure of the LC-18 aptamer was predicted by using OligoAnalyzer and MFold online software under the conditions typical small-angle X-ray scattering (SAXS) experiment. The molecular modeling of the aptamer was carried out using the Avogadro program. For prediction of the structure two computational methods were used: quantum-mechanical method with third-order density-functional tight-binding (DFTB3) and molecular dynamics (MD) with force fields. Results. In this paper it was shown that molecular simulations can predict structures from the SAXS experiments. OligoAnalyzer and MFold web servers have been used to generate a set of several likely models. However, more accurate calculations have showed that these models do not predict the relative importance of isomers. Meanwhile, application of quantum-chemical and molecular dynamics calculations have showed reliable molecular structures which have a small deviations from the experimental SAXS curves. Conclusion. This study demonstrates the approach for modeling 3D structures of DNA-aptamers in solution using both experimental and theoretical meth-ods. It could be very helpful in designing more efficient aptamers based on results obtained from molecular simulations.
Смотреть статью,
РИНЦ,
Scopus,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

10.

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Moryachkov R. V., Nikolaeva P. A., Spiridonova V. A.
Заглавие : Structure approaches to study of DNA aptamers in solution
Место публикации : Sib. Med. Rev. - 2021. - Vol. 2021, Is. 2. - P.76-78. - ISSN 18199496 (ISSN), DOI 10.20333/2500136-2021-2-76-78; Сиб. мед. обозрение
Примечания : Cited References: 5. - The reported study was funded by RFBR, project number 19-32-90266
Аннотация: The high potential of aptamers – specific molecular agents based on short single-stranded nucleic acids – makes high demands on the molecules under development for the efficiency of interaction with target biomolecules. In this work, approaches are considered for studying the spatial structure of DNA aptamers in solution using various complementary methods, which make it possible to obtain a more complete picture of the formation of the structure and conformational changes, to track the interaction with the target protein, the tendency to oligomerization, and to characterize the spatial structure of both individual molecules and complexes.
Смотреть статью,
РИНЦ,
Scopus,
Читать в сети ИФ
Найти похожие