Библиотека института физики им. Л.В. Киренского СО РАН

Главная

Базы данных

Труды сотрудников ИФ СО РАН - результаты поиска

Вид поиска

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН

Каталог журналов библиотеки ИФ СО РАН

Труды сотрудников ИФ СО РАН

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД:

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН (1)

Формат представления найденных документов:
полный	информационный	краткий

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>K=aptamers<.>)

Общее количество найденных документов : 31
Показаны документы с 1 по 10

1-10 11-20 21-31 31-31

    Получение высокоселективных аптамеров к онколитическому вирусу VV-GMCSF-Lact. Теоретические и экспериментальные подходы / М. А. Дымова, Е. В. Кулигина, В. А. Рихтер [и др.] // Сиб. мед. обозрение. - 2023. - № 5. - С. 95-101 ; Sib. Med. Rev., DOI 10.20333/25000136-2023-5-95-101. - Библиогр.: 21. - Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 22-64-00041, https://rscf.ru/project/22-64-00041/. Работа также поддержана в рамках государственного задания ИХБФМ СО РАН No121030200173-6 (наработка вируса). Авторы благодарят Межведомственный суперкомпьютерный центр Российской академии наук (МСЦ РАН) за предоставление вычислительных мощностей . - ISSN 1819-9496. - ISSN 2500-0136
   Перевод заглавия: Obtaining highly selective aptamers to the VV-GMCSF-Lact oncolytic virus. Theoretical and experimental approaches
Кл.слова (ненормированные):
аптамеры -- SELEX -- онколитический вирус VV-GMCSF-Lact -- цитофлуориметрия -- молекулярная динамика -- компьютерное моделирование -- aptamers -- SELEX -- VV-GMCSF-Lact oncolytic virus -- cytofluorimetry -- molecular dynamics -- computer modelling
Аннотация: Введение. Деструкция злокачественных опухолей с помощью онколитических вирусов – один из наиболее эффективных и безопасных способов противоопухолевой терапии. Для получения доступа к опухолевым клеткам вирус должен длительное время циркулировать в кровотоке, избегая действия иммунной системы. Однако при введении вируса в организм он провоцирует выработку вируснейтрализующих антител, снижающих его противоопухолевый эффект. Наиболее эффективным способом защиты вируса от нейтрализующих антител является его экранирование, в частности, с помощью селективных к нему ДНК-аптамеров. Цель исследования. С помощью экспериментальных методов и теоретических расчётов разработать подходящие для создания противоопухолевого препарата на основе онколитического вируса VV-GMCSF-Lact ДНК-аптамеры, эффективно экранирующие вирусы и способные защитить их от вируснейтрализующих антител. Материал и методы. Моделирование вторичных структур аптамеров выполнено в программе для фолдинга нуклеиновых кислот mFold, моделирование соответствующих пространственных полноатомных структур аптамеров – в программах SimRNA и VMD. Расчёты молекулярной динамики проведены в программном пакете GROMACS 2018.8. Кластерный анализ полученных молекулярно-динамических траекторий выполнен в программе VMD. Оценка связывания Cy5-модифицированных аптамеров с вирусом проведена с помощью проточной цитометрии на цитофлуориметре BD FACSCanto II (Becton Dickinson, г. Франклин Лейкс, Нью-Джерси, США). Результаты. Модификация аптамеров, экспериментально полученных с помощью технологии SELEX, позволила получить пять укороченных олигонуклеотидов NV1t_72, NV4t_64, NV4t_53, NV14t_41 и NV14t_57, экранирующих онколитический вирус VV-GMCSF-Lact, самым эффективным из которых оказался аптамер NV14t_57. Теоретические расчёты показали, что аффинность аптамеров определяется их трёхмерной структурой, зависящей от способа модификации. Заключение. Получен высокоселективный аптамер NV14t_57, который является наиболее перспективным кандидатом для дальнейшей работы по созданию препарата для противоопухолевой терапии онкологических заболеваний на основе онколитического вируса осповакцины VVGMCSF-Lact.
Introduction. Destruction of malignant tumours with oncolytic viruses is one of the most effective and safe methods of antitumor therapy. To gain access to tumour cells, the virus must circulate in the bloodstream for a long time, avoiding the action of the immune system. However, when a virus is introduced into the body, it provokes the production of virus-neutralising antibodies that reduce its antitumor effect. The most effective way to protect a virus from antibodies that neutralise it is to screen it: in particular, using selective DNA aptamers. The aim of the research. Using experimental methods and theoretical calculations, to develop DNA aptamers suitable for creating an antitumor drug based on the VV-GMCSF-Lact oncolytic virus, which effectively screen viruses and can protect them from virus-neutralising antibodies. Material and methods. Modelling of the secondary structures of aptamers was performed using the mFold program for nucleic acid folding, modelling of the corresponding spatial full-atom structures of aptamers was performed using the SimRNA and VMD programs. Molecular dynamics calculations were carried out using the GROMACS 2018.8 software package. Cluster analysis of the obtained molecular dynamic trajectories was performed using the VMD program. Binding of Cy5-modified aptamers to the virus was assessed using flow cytometry on a BD FACSCanto II cytometer (Becton Dickinson, Franklin Lakes, New Jersey, USA). Results. Modification of aptamers experimentally obtained using the SELEX technology made it possible to obtain five truncated oligonucleotides NV1t_72, NV4t_64, NV4t_53, NV14t_41, and NV14t_57, which screen the oncolytic virus VV-GMCSF-Lact, the most effective of which was the NV14t_57 aptamer. Theoretical calculations have shown that the affinity of aptamers is determined by their three-dimensional structure, which depends on the method of modification. Conclusion. A highly selective aptamer NV14t_57 has been obtained, which is the most promising candidate for further work on the creation of a drug for antitumor therapy of oncological diseases based on the VV-GMCSF-Lact oncolytic vaccinia virus.

Смотреть статью,
РИНЦ,
Scopus
Держатели документа:
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск 630090, Российская Федерация
Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В. Ф. Войно-Ясенецкого, Красноярск 660022, Российская Федерация
Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр» СО РАН, Красноярск 660036, Российская Федерация
Сибирский федеральный университет, Красноярск 660041, Российская Федерация
Институт физики им. Л. В. Киренского СО РАН, Красноярск 660036, Российская Федерация

Доп.точки доступа:
Дымова, М. А.; Кулигина, Е. В.; Рихтер, В. А.; Артюшенко, П. В.; Рогова, А. В.; Щугорева, И. А.; Томилин, Феликс Николаевич; Tomilin, F. N.; Кичкайло, А. С.; Замай, Т. Н.

}
Найти похожие

    Адресная деструкция злокачественных опухолей биоконъюгатами на основе аптамеров / А. В. Дубынина [и др.] // Сиб. мед. обозрение. - 2016. - Т. 101, № 5. - С. 88-90. - Библиогр.: 2 . - ISSN 1819-9496
   Перевод заглавия: Targeted destruction of malignant tumors by bioconjugates on the base of aptamers
Кл.слова (ненормированные):
аптамеры -- золотые наночастицы -- магнитные микродиски -- гипертермия -- плазмонный -- резонанс -- aptamers -- gold nanoparticles -- magnetic microdiscs -- hyperthermia -- plasmon resonance
Аннотация: Широкое распространение в терапии онкологических заболеваний в последние годы получили методы, основанные на применении различных типов наночастиц. Для повышения адресности Адресная деструкция злокачественных опухолей биоконъюгатами на основе аптамеров воздействия применяют различные молекулы, обладающие высокой специфичностью, одними из которых являются аптамеры. В работе исследовался эффект воздействия на опухоль конъюгатов наночастиц золота с аптамерами при воздействии лазера, а также оценивалась гибель клеток опухоли при использовании конъюгатов магнитных микродисков с аптамерами в условиях переменного магнитного поля. Исследование показало возможность применения исследуемых конъюгатов в качестве средств адресной деструкции опухоли.
Widespread in cancer therapy in recent years have become the methods based on the use of different types of nanoparticles. To improve the targeting of the impact are used various molecules having high specificity, some of them are aptamers. The paper studied the effect of influence on the tumor the conjugates of gold nanoparticles with aptamers at laser exposure, as well as tumor cell death was assessed after using the conjugates of magnetic microdiscs with aptamers in a variable magnetic field. The study showed the possibility of using the studied conjugates as agents of targeted destruction of tumor.

РИНЦ,
Читать в сети ИФ
Держатели документа:
Институт физики СО РАН
ФГАОУ ВО «Сибирский федеральный университет»
ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени проф. В. Ф. Войно-Ясенецкого
Центр ядерной медицины Сибирского клинического центра ФМБА России

Доп.точки доступа:
Дубынина, А. В.; Dubynina A. V.; Замай, Т. Н.; Zamay T. N.; Коловская, О. С.; Kolovskaya O. S.; Кичкайло, Анна Сергеевна; Kichkaylo A.S.; Белянина, И. В.; Belyanina I. V.; Чанчикова, Н. Г.; Chanchikova N. G.; Токарев, Н. А.; Tokarev N. A.; Карлова, Е. А.; Karlova E. A.; Александровский, Александр Сергеевич; Aleksandrovskiy, A. S.; Шепелевич, Н. В.; Shepelevich N. V.; Озерская, А. В.; Ozerskaya A.V.; Бадрин, Е. А.; Badrin E. A.; Белугин, К. В.; Belugin K. V.; Белкин, С. А.; Belkin S. A.; Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого
}
Найти похожие

Structure- and interaction-based design of anti-SARS-CoV-2 Aptamers / V. Mironov, I. A. Shchugoreva, P. V. Artyushenko [et al.] // Chem. - Eur. J. - 2022. - Vol. 28, Is. 12. - Ст. e202104481, DOI 10.1002/chem.202104481. - Cited References: 85. - The authors are grateful to JCSS Joint Super Computer Center of the Russian Academy of Sciences – Branch of Federal State Institution “Scientific Research Institute for System Analysis of the Russian Academy of Sciences” for providing supercomputers for computer simulations. The authors thank the RSC Group (www.rscgroup.ru) and personally Mr. Oleg Gorbachev for the constant support and establishment of “The Good Hope Net Project” (www.thegoodhope.net) multifunctional non-profit anti-CoVID research project. The authors also thank the Helicon Company (www.helicon.ru) and personally Olesya Kucenko, Alexander Kolobov, Leonid Klimov for instrumental support and help with conducting fluorescence polarization assays, which were performed on a demo instrument Clariostar Plus microplate reader (BMG LABTECH, Germany). We thank Dr. Yong-Zhen Zhang for providing the genome sequence of 2019-nCoV and Dr. Xinquan Wang for providing the crystal structure of the binding domain of the SARS-2 Spike protein. The authors are grateful to Aptamerlab LCC financial support (www.aptamerlab.com). Y.A.’s work at Argonne National Laboratory was supported by the U.S. Department of Energy, Office of Science, under contract DE-AC02-06CH11357. The work of D.M. and G.G. has been done as part of the BioExcel CoE (www.bioexcel.eu), a project funded by the European Union contracts H2020-INFRAEDI-02-2018-823830 and H2020-EINFRA-2015-1-675728. D.M. and G.G. also thank the CSC-IT center in Espoo, Finland, as well as PRACE for awarding access to resource Curie-Rome based in France at GENCI. V.M. thanks Russian Foundation for Basic Research (project number 19-03-00043). A.B.’s and N.K.’s work was supported by the Ministry of Science and Higher Education of Russian Federation (state assignment of the Research Center of Biotechnology RAS). V. deF. G.C., N.B and G.O. are grateful to FISR2020 _00177 Shield, Italian Ministry of Education and Research, for funding. GC is grateful to the European Union's Horizon 2020 research and innovation program under the Marie Skłodowska-Curie grant agreement: cONCReTE 872391; PRISAR2 872860. Use of the 13 A BioSAXS beamtime at the Taiwan Photon Source is acknowledged. The work of M.V.B was funded by the Canadian Institutes of Health Research grant OV1-170353. SAXS measurements and PIEDA analyses were funded by the Russian Science Foundation (project No 21-73-20240 for A.S.K.) . - ISSN 0947-6539. - ISSN 1521-3765

РУБ Chemistry, Multidisciplinary
Рубрики:
BIOLOGICAL MACROMOLECULES
   SOLUTION SCATTERING
   BINDING
   SPIKE
Кл.слова (ненормированные):
aptamers -- fragment molecular orbitals method -- molecular dynamics -- SARS-CoV-2 -- SAXS
Аннотация: Aptamer selection against novel infections is a complicated and time-consuming approach. Synergy can be achieved by using computational methods together with experimental procedures. This study aims to develop a reliable methodology for a rational aptamer in silico et vitro design. The new approach combines multiple steps: (1) Molecular design, based on screening in a DNA aptamer library and directed mutagenesis to fit the protein tertiary structure; (2) 3D molecular modeling of the target; (3) Molecular docking of an aptamer with the protein; (4) Molecular dynamics (MD) simulations of the complexes; (5) Quantum-mechanical (QM) evaluation of the interactions between aptamer and target with further analysis; (6) Experimental verification at each cycle for structure and binding affinity by using small-angle X-ray scattering, cytometry, and fluorescence polarization. By using a new iterative design procedure, structure- and interaction-based drug design (SIBDD), a highly specific aptamer to the receptor-binding domain of the SARS-CoV-2 spike protein, was developed and validated. The SIBDD approach enhances speed of the high-affinity aptamers development from scratch, using a target protein structure. The method could be used to improve existing aptamers for stronger binding. This approach brings to an advanced level the development of novel affinity probes, functional nucleic acids. It offers a blueprint for the straightforward design of targeting molecules for new pathogen agents and emerging variants.

Смотреть статью,
Scopus,
WOS
Держатели документа:
Lomonosov Moscow State Univ, Dept Chem, Moscow 119991, Russia.
Kyungpook Natl Univ, Dept Chem, Daegu 702701, South Korea.
Fed Res Ctr KSC SB RAS, Lab Digital Controlled Drugs & Theranost, Krasnoyarsk 660036, Russia.
Natl Tsing Hua Univ, Dept Chem Engn, Hsinchu 30013, Taiwan.
Siberian Fed Univ, Sch Nonferrous Met & Mat Sci, Krasnoyarsk 660041, Russia.
IRCCS Neuromed Ist Neurol Mediterraneo Pozzilli, Via Atinense 18, I-86077 Pozzilli, Italy.
Krasnoyarsk State Med Univ, Lab Biomol & Med Technol, Krasnoyarsk 660022, Russia.
Univ Jyvaskyla, Nanosci Ctr, Jyvaskyla 40014, Finland.
Univ Jyvaskyla, Dept Chem, Jyvaskyla 40014, Finland.
Univ Naples Federico II, Dept Pharm, I-80138 Naples, Italy.
Univ Naples Federico II, Dept Mol Med & Med Biotechnol, I-80131 Naples, Italy.
Kirensky Inst Phys, Lab Phys Magnet Phenomena, Krasnoyarsk 660012, Russia.
Siberian Fed Univ, Sch Fundamental Biol & Biotechnol, Krasnoyarsk 660041, Russia.
Xiamen Univ, Coll Chem & Chem Engn, Dept Chem Biol, Xiamen 361005, Peoples R China.
State Res Ctr Virol & Biotechnol Vector, Koltsov 630559, Russia.
NRC Kurchatov Inst, Moscow 117259, Russia.
Russian Acad Sci, Siberian Branch, Inst Chem Biol & Fundamental Med, Novosibirsk 630090, Russia.
Russian Acad Sci, Res Ctr Biotechnol, AN Bach Inst Biochem, Lab Immunobiochem, Moscow 119071, Russia.
Tomsk State Univ, Lab Adv Mat & Technol, Tomsk 634050, Russia.
Altai State Univ, Barnaul 656049, Russia.
Fed Res Ctr KSC SB RAS, Dept Mol Elect, Krasnoyarsk 660036, Russia.
Krasnoyarsk State Med Univ, Dept Infect Dis & Epidemiol, Krasnoyarsk 660022, Russia.
Natl Pingtung Univ, Dept Appl Chem, Pingtung 900391, Taiwan.
Natl Synchrotron Radiat Res Ctr, Hsinchu Sci Pk, Hsinchu 30076, Taiwan.
Res Natl Council CNR, Inst Genet & Biomed Res IRGB, I-09042 Milan, Italy.
Shanghai Jiao Tong Univ, Sch Med, Renji Hosp, Inst Mol Med, Shanghai 200127, Peoples R China.
Natl Inst Adv Ind Sci & Technol, Res Ctr Computat Design Adv Funct Mat, Tsukuba, Ibaraki 3058560, Japan.
Hunan Univ, Coll Chem & Chem Engn, Changsha 410082, Hunan, Peoples R China.
Argonne Natl Lab, Computat Sci Div, Lemont, IL 60439 USA.
Dept Chem & Biomol Sci, Ottawa, ON K1N 6N5, Canada.

Доп.точки доступа:
Mironov, Vladimir; Shchugoreva, I. A.; Artyushenko, P. V.; Артюшенко, Полина Владимировна; Morozov, D. I.; Морозов, Дмитрий И.; Borbone, N.; Oliviero, G.; Zamay, T. N.; Замай, Т. Н.; Moryachkov, R. V.; Морячков, Роман Владимирович; Kolovskaya, .; Коловская О. С.; Lukyanenko, K. A.; Лукьяненко Кирилл А.; Song, Y. L.; Merkuleva, I. A.; Zabluda, V. N.; Заблуда, Владимир Николаевич; Peters, G.; Koroleva, L. S.; Veprintsev, D. V.; Glazyrin, Y. E.; Volosnikova, E. A.; Belenkaya, S. V.; Esina, T. I.; Isaeva, A. A.; Nesmeyanova, .; Shanshin, D. V.; Berlina, A. N.; Komova, N. S.; Svetlichnyi, V. A.; Silnikov, V. N.; Shcherbakov, D. N.; Zamay, G. S.; Замай, Галина Сергеевна; Zamay, S. S.; Замай, С. С.; Smolyarova, T. E.; Смолярова, Татьяна Евгеньевна; Tikhonova, E. P.; Chen, U. S.; Jeng, G.; Condorelli, V.; Franciscis, G.; Groenhof, C. Y.; Yang, A. A.; Moskovsky, D. G.; Fedorov, F. N.; Tomilin, F. N.; Томилин, Феликс Николаевич; Tan, Y.; Alexeev, M. V.; Berezovski, A. S.; Kichkailo, A.S.; Aptamerlab LCC; U.S. Department of Energy, Office of ScienceUnited States Department of Energy (DOE) [DE-AC02-06CH11357]; European UnionEuropean Commission [H2020-INFRAEDI-02-2018-823830, H2020-EINFRA-2015-1-675728, 872391, PRISAR2 872860]; CSC-IT center in Espoo, Finland; PRACE; Russian Foundation for Basic ResearchRussian Foundation for Basic Research (RFBR) [19-03-00043]; Ministry of Science and Higher Education of Russian Federation (state assignment of the Research Center of Biotechnology RAS); Italian Ministry of Education and ResearchMinistry of Education, Universities and Research (MIUR) [FISR2020 _00177]; Canadian Institutes of Health ResearchCanadian Institutes of Health Research (CIHR) [OV1-170353]; Russian Science FoundationRussian Science Foundation (RSF) [21-73-20240]
}
Найти похожие

Moryachkov, R. V.
Structure approaches to study of DNA aptamers in solution / R. V. Moryachkov, P. A. Nikolaeva, V. A. Spiridonova // Sib. Med. Rev. - 2021. - Vol. 2021, Is. 2. - P. 76-78 ; Сиб. мед. обозрение, DOI 10.20333/2500136-2021-2-76-78. - Cited References: 5. - The reported study was funded by RFBR, project number 19-32-90266 . - ISSN 1819-9496
Кл.слова (ненормированные):
biomolecules in solution -- tertiary structure -- small-angle X-ray scattering (SAXS) -- structure analysis
Аннотация: The high potential of aptamers – specific molecular agents based on short single-stranded nucleic acids – makes high demands on the molecules under development for the efficiency of interaction with target biomolecules. In this work, approaches are considered for studying the spatial structure of DNA aptamers in solution using various complementary methods, which make it possible to obtain a more complete picture of the formation of the structure and conformational changes, to track the interaction with the target protein, the tendency to oligomerization, and to characterize the spatial structure of both individual molecules and complexes.

Смотреть статью,
РИНЦ,
Scopus,
Читать в сети ИФ
Держатели документа:
Federal Research Center “Krasnoyarsk Science Center SB RAS”, 50, Akademgorodok St., Krasnoyarsk, 660036, Russian Federation
Kirensky Institute of Physics, Bld. 38, 50, Akademgorodok St., Krasnoyarsk, 660036, Russian Federation
Lomonosov Moscow State University, 1, Leninskie Gory St., Moscow, 119992, Russian Federation
A. N. Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology, Lomonosov Moscow State University, Bld. 40, 1, Leninskie Gory St., Moscow, 119992, Russian Federation

Доп.точки доступа:
Nikolaeva, P. A.; Spiridonova, V. A.; Морячков, Роман Владимирович

}
Найти похожие

Structural analysis of thrombin-binding G-aptamers in presence of bivalent ions / P. A. Nikolaeva, R. V. Moryachkov, V. N. Raldugina [et al.] // Sib. Med. Rev. - 2022. - Is. 5. - P. 111-113 ; Сиб. мед. обозрение, DOI 10.20333/25000136-2022-5-111-113. - Cited References: 4. - The study was supported by a grant from the Russian Science Foundation (project number 21-73-20240) . - ISSN 1819-9496
Кл.слова (ненормированные):
3D structures -- DNA aptamers -- thrombin inhibitors -- G-quadruplexes
Аннотация: The aim of this study was to examine 3D structures of DNA aptamers, thrombin inhibitors. The main objective was to study 3D structure 15TBA, RE31, NU172 aptamers using the small-angle X-ray scattering method. The size of 15TBA was 4.5 nm, which corresponds to a partially unfolded conformation. The CD spectrum of Nu172 in the presence of 50 mM strontium ions indicates the presence of an antiparallel G-quadruplex, the concentration o f which drops at 50°C. NU172 does not have a rigid structure, apparently due to the presence of a guanine residue in the GT loop. The NU172 aptamer does not form a stable conformation in solution either without ions or with Ba2+ and Sr2+ ions. It was shown that there is possibility of aptamers transition from one conformation to another dependently on concentration and temperature confirms that the potassium ion is a unique stabilizing ion of natural molecules containing G-quadruplexes.

Смотреть статью,
РИНЦ,
Scopus
Держатели документа:
Department bioimformatics and bioengineery, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119992, Russian Federation
Federal Research Center «Krasnoyarsk Science Center SB RAS», Krasnoyarsk, 660036, Russian Federation
Kirensky Institute of Physics, Krasnoyarsk, 660036, Russian Federation
Belozersky Institute of physical chemical biology, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119992, Russian Federation

Доп.точки доступа:
Nikolaeva, P. A.; Moryachkov, R. V.; Морячков, Роман Владимирович; Raldugina, V. N.; Naumova, Iu. O.; Novikova, T. M.; Spiridonova, V. A.

}
Найти похожие

"Smart" nanoscalpel for microsurgery of glial tumors of the human brain / S. S. Zamay, A. A. Narodov, R. G. Galeev [et al.] // Sib. Med. Rev. - 2022. - Is. 5. - P. 109-110 ; Сиб. мед. обозрение, DOI 10.20333/25000136-2022-5-109-110. - Cited References: 2. - This research was funded by the Regional State Autonomous Institution "Krasnoyarsk Regional Fund for Support of Scientific and Scientific and Technical Activities", Competition of scientific, technical and innovative projects in the interests of the first world-class climate scientific and educational center "Yenisei Siberia", grant “Carrying out applied research and development aimed at creating technologies for the production of nanoscalpels based on magnetic nanodisks for microsurgery of glial brain tumors” № 2022060108781 and with the support of a partner company JSC «NPP «Radiosviaz» . - ISSN 1819-9496
Кл.слова (ненормированные):
aptamers -- glial tumor -- NMR tomography -- «smart» nanoscalpel -- nanodiscs -- magnetomechanical therapy
Аннотация: We studied the effectiveness of magnetomechanical therapy in the treatment of brain glial tumors using magnetic nanodiscs functionalized with DNA aptamers to human brain tumor glial cells. Materials and methods. The formation of a model of human glioblastoma was carried out by intracranial injection of tumor cells of glioblastoma obtained from a patient with glioblastoma. Antitumor therapy was carried out using nanodiscs modified with the Gli233 aptamer. The growth of the glial tumor was monitored using NMR tomography. Results and discussion. Therapy of a glial tumor during 4 sessions of magnetomechanical therapy using a "smart" nanoscalpel in MF (10Hz, 100Oe) led to a significant reduction in its size, while glial tumors in mice that were treated with nanodiscs modified with nonspecific aptamers continued to increase in size. Conclusion. Microsurgery using three-layer magnetic nanodisks with a quasi-dipole structure (Au/Ni/Au) modified with the specific for glial cells Gli233 aptamer (“smart” nanoscalpel) is effective for the treatment of human glial tumors in the brain.

Смотреть статью,
РИНЦ,
Scopus
Держатели документа:
Federal Research Center "Krasnoyarsk Science Center of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences", Krasnoyarsk, 660036, Russian Federation
Prof. V. F. Voino-Yasenetsky Krasnoyarsk State Medical University, Krasnoyarsk, 660022, Russian Federation
JSC «NPP «Radiosviaz», Krasnoyarsk, 660021, Russian Federation
V.P. Astafiev Krasnoyarsk State Pedagogical University, Krasnoyarsk, 660049, Russian Federation
L.V. Kirensky Institute of Physics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Krasnoyarsk, 660036, Russian Federation

Доп.точки доступа:
Zamay, S. S.; Narodov, A. A.; Galeev, R. G.; Prokopenko, V. S.; Sokolov, A. Е.; Соколов, Алексей Эдуардович; Borus, A. A.; Борус, Андрей Андреевич; Zabluda, V. N.; Заблуда, Владимир Николаевич; Lukyanenko, A. V.; Лукьяненко, Анна Витальевна; Baron, F. A.; Барон, Филипп Алексеевич; Garifullin, V. F.; Masyugin, A. N.; Zelenov, F. V.; Grek, D. S.; Voronkovskii, I. I.; Gorbushin, A.; Kolovskaya, O. S.; Lukyanenko, K. A.; Nikolaeva, E. D.; Luzan, N. A.; Kichkailo, A. S.

}
Найти похожие

Small-Angle scattering applications to the analysis of aptamer structure and conformational changes / R. V. Moryachkov, V. N. Zabluda, A. Е. Sokolov [et al.] // Molecular Therapy - Nucleic Acids : book of abstracts of the 1st Int. conf. "Aptamers in Russia 2019". - 2019. - Vol. 17, Suppl. 1. - P. 4

Материалы конференции

Доп.точки доступа:
Moryachkov, R. V.; Морячков, Роман Владимирович; Zabluda, V. N.; Заблуда, Владимир Николаевич; Sokolov, A. Е.; Соколов, Алексей Эдуардович; Shchugoreva, I. A.; Tomilin, F. N.; Томилин, Феликс Николаевич; Peters, G.; Петерс Георгий; Spiridonova, V. A.; Спиридонова В. А.; Aptamers in Russia, international conference(1 ; 2019 ; Aug. 27-30 ; Krasnoyarsk)
}
Найти похожие

Silicon nanowire based biosensor for detection of organic molecules / A. S. Tarasov, A. V. Lukyanenko, T. E. Smolyarova [et al.] // Molecular Therapy - Nucleic Acids : book of abstracts of the 1st Int. conf. "Aptamers in Russia 2019". - 2019. - Vol. 17, Suppl. 1. - P. 4-5

Материалы конференции

Доп.точки доступа:
Tarasov, A. S.; Тарасов, Антон Сергеевич; Lukyanenko, A. V.; Лукьяненко, Анна Витальевна; Smolyarova, T. E.; Смолярова, Татьяна Евгеньевна; Shanidze, L. V.; Шанидзе, Лев Викторович; Yakovlev, I. A.; Яковлев, Иван Александрович; Volkov, N. V.; Волков, Никита Валентинович; Aptamers in Russia, international conference(1 ; 2019 ; Aug. 27-30 ; Krasnoyarsk)
}
Найти похожие

Selection of DNA aptamers for breast cancer / G. S. Zamay, I. V. Belyanina, A. S. Zamay [et al.] // Biochem. Mosc.-Suppl. Ser. B-Biomed. Chem. - 2016. - Vol. 10, Is. 2. - P. 158-164, DOI 10.1134/S1990750816020128. - Cited References:23 . - ISSN 1990-7508. - ISSN 1990-7516

РУБ Biochemistry & Molecular Biology
Рубрики:
BIOMARKERS
MORTALITY
PATTERNS
Кл.слова (ненормированные):
SELEX -- DNA aptamers -- oligonucleotides -- breast cancer
Аннотация: A method of selection of DNA aptamers to breast tumor tissue based on the use of postoperative material has been developed. Breast cancer tissues were used as the positive target; the negative targets included benign tumor tissue, adjacent healthy tissues, breast tissues from mastopathy patients, and also tissues of other types of malignant tumors. During selection a pool of DNA aptamers demonstrating selective binding to breast cancer cells and tissues and insignificant binding to breast benign tissues has been obtained. These DNA aptamers can be used for identification of protein markers, breast cancer diagnostics, and targeted delivery of anticancer drugs.

Смотреть статью,
Scopus,
WOS,
Читать в сети ИФ

Публикация на русском языке Селекция ДНК-аптамеров для диагностики рака молочной железы [Текст] / Г. С. Замай [и др.] // Биомедицинская химия. - Москва : Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича, 2016. - Т. 62 № 4. - С. 411-417

Держатели документа:
Kirensky Inst Phys, Krasnoyarsk, Russia.
Voino Yasenetski Krasnoyarsk State Med Univ, Ul Partizana Zheleznyaka 1, Krasnoyarsk 660022, Russia.
KKRCCC, Krasnoyarsk, Russia

Доп.точки доступа:
Zamay, G. S.; Замай, Г. С.; Belyanina, I. V.; Zamay, A. S.; Замай, Анна Сергеевна; Komarova, M. A.; Krat, A. V.; Eremina, E. N.; Zukov, R. A.; Sokolov, A. Е.; Соколов, Алексей Эдуардович; Zamay, T. N.; Замай, Т. Н.
}
Найти похожие

10.

Obtaining and properties of biomagnetic nanoconjugates based on DNA aptamers and magnetic nanoparticles for magnetodynamic cell therapy / A. Е. Sokolov, A. V. Kurilova, V. A. Svetlichniy [et al.] // The Fifth Asian School-Conference on Physics and Technology of Nanostructured Materials : Proceedings. - VLadivostok : Dalnauka Publishing, 2020. - Ст. V.01.17o. - P. 147 . - ISBN 978-5-8044-1698-1

Материалы конференции,
Читать в сети ИФ

Доп.точки доступа:
Sokolov, A. Е.; Соколов, Алексей Эдуардович; Kurilova, A. V.; Svetlichniy, V. A.; Velikanov, D. A.; Великанов, Дмитрий Анатольевич; Sherepa, A. V.; Volochaev, M. N.; Волочаев, Михаил Николаевич; Goncharova, D. A.; Shabalina, A. V.; Asian School-Conference on Physics and Technology of Nanostructured Materials(5 ; 2020 ; 30 Jul - 3 Aug ; Vladivostok); Азиатская школа-конференция по физике и технологии наноструктурированных материалов(5 ; 2013 ; 30 июля - 3 авг. ; Владивосток)
}
Найти похожие