Библиотека института физики им. Л.В. Киренского СО РАН

Главная

Базы данных

Труды сотрудников ИФ СО РАН - результаты поиска

Вид поиска

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН

Каталог журналов библиотеки ИФ СО РАН

Труды сотрудников ИФ СО РАН

Область поиска

в найденном

Формат представления найденных документов:
полный	информационный	краткий

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>K=bacteria<.>)

Общее количество найденных документов : 19
Показаны документы с 1 по 10

1-10 11-19

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Vysotski E. S., Zavoruev V. V., Mezhevikin V. V., Rodicheva E. K., Fish A. M., Gitelzon I. I.
Заглавие : Bioluminescence of cell-free-extracts of luminous bacteria
Место публикации : Doklady Akademii Nauk. - 1981. - Vol. 261, Is. 1. - P.216-219. - ISSN 0002-3264
Примечания : Cited References: 8
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Salnikov M. V., Medvedeva S. E., Petushkov V. N., Gitelzon I. I.
Заглавие : Electron-microscope study of the structure of luciferase from luminescent bacteria
Место публикации : Doklady Akademii Nauk. - 1981. - Vol. 261, Is. 5. - P.1254-1256. - ISSN 0002-3264
Примечания : Cited References: 4
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Stolyar S. V., Ladygina V. P., Boldyreva A. V., Kolenchukova O. A., Vorotynov A. M., Bairmani M. S., Yaroslavtsev R. N., Iskhakov R. S.
Заглавие : Synthesis, Properties, and in vivo Testing of Biogenic Ferrihydrite Nanoparticles
Место публикации : Bull. Russ. Acad. Sci. Phys. - 2020. - Vol. 84, Is. 11. - P.1366-1369. - ISSN 10628738 (ISSN), DOI 10.3103/S106287382011026X
Примечания : Cited References: 12. - The study was supported by the Russian Foundation for Basic Research, the Government of the Krasnoyarsk krai, the Krasnoyarsk Regional Fund for the Support of Scientific and Technical Activities (project no. 19-42-240012 r_a “Magnetic Resonance in Ferrihydrite Nanoparticles: Effects Associated with the Core–Shell Structure”), and the grant of the President of the Russian Federation for state support of young Russian scientists—Candidates of sciences no. MK-1263.2020.3
Аннотация: A sol containing biogenic ferrihydrite nanoparticles is obtained by cultivating Klebsiella oxytoca microorganisms. Data on the physical properties of the biogenic ferrihydrite and its effect on the organism of laboratory animals are obtained using a model of experimental hemolytic anemia, according to indicators of the functional activity of erythrocytes and morphological descriptions of organs.
Смотреть статью,
Scopus,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Shabanova O. V., Nemtsev I. V., Shabanov A. V.
Заглавие : Development of SEM method for analysis of organ-containing objects using inverse opals
Место публикации : Sib. J. Sci. Technol. - 2020. - Vol. 21, Is. 4. - P.565-573. - ISSN 2587-6066, DOI 10.31772/2587-6066-2020-21-4-565-573; \b Сибирский журнал науки и технологий
Примечания : Cited References: 25
Аннотация: The purpose of this study is to test the possibility of using inorganic macroporous structures of inverse opal in sample preparation for scanning electron microscopy of biological objects. As an absorbent substrate we used silica inverse opals prepared by a sol-gel method to study the biological objects.The process of manufacturing the inverse opal involves a complex multi-stage technological process. First, we synthesized submicron spherical particles from polymethylmethacrylate by the method of emulsifier-free emulsion polymerization of methylmethacrylate in an aqueous medium in the presence of a diazoinitiator. This method can be used to obtain an ensemble of particles with high monodispersity, the average size of which can vary in the range from 100 to 500 nm. Then, by self-assembly technique, we deposited the beads of polymethylmethacrylate into ordered matrices (templates), mainly with a face-centered cubic lattice. The resulting mesoporous structures, called artificial opals or colloidal crystals, had lateral dimensions of about 10 × 10 × 2 mm. Then we heat-treated the opals to 120 °C to harden the template before being impregnated with the precursor. Further, we impregnated the opals with silica sol with a particle size distribution from 1 to 5 nm, obtained by hydrolysis of tetraethoxysilane in the presence of hydrochloric acid, and then, after curing and drying the impregnating composition in air at room temperature, we multi-stage fired them up to 550 °C at normal pressure in the air atmosphere to remove all organic components. As a result, the macroporous metamaterial (the so-called inverse opals) with an open system of pores up to 400 nm in size, occupying about 80 % of the volume, were obtained. We studied lactic acid bacteria of cucumber brine and human red blood cells with TM4000 Plus, SU3500 and S-5500 scanning electron microscopes. Auxiliary substance for the sample preparation was ionic liquid VetexQ EM (Interlab LLC). We showed that it is possible to use the inverse opal as an absorbent substrate for sample preparation and rapid analysis in scanning electron microscopy without pre-drying, chemical treatment, or temperature exposure. To improve imaging in the electron microscope, we used sputter coater to cover the inverse opal surface with a thin film of platinum. The use of ionic liquid in combination with the absorbent porous medium allows preserving an original shape of the biological structures. Using the human red blood cells and lactic acid bacteria, we showed that it is possible to carry out of the morphological analysis of the cells using various scanning electron microscopes. We found that on the basis of the inverse opal, there is a fundamental possibility of creating the absorbent substrate suitable for repeated use in the study of the biological objects. At the same time, trace remnants of previous samples remaining after annealing the plate do not introduce significant distortions when conducting new series of observations. In this study, we obtained high-quality electronic micrographs of the biological objects with high resolution and contrast. At the same time, due to the use of the inverse opals as the absorbent substrate, time and financial costs for researchare reduced.Целью данного исследования является апробация возможности применения неорганических макропористых структур инверсного опала при пробоподготовке для сканирующей электронной микроскопии биообъектов. Изготовленные золь-гель способом инверсные опалы на основе кремнезёма применялись в качестве впитывающей подложки для изучения биологических образцов. Изготовление инверсного опала представляет собой сложный многоступенчатый технологический процесс. Сначала методом безэмульгаторной эмульсионной полимеризации метилметакрилата в водной среде в присутствии диазоинициатора были синтезированы субмикронные сферические частицы из полиметилметакрилата. Таким способом можно получать ансамбль частиц с высокой монодисперсностью, средний размер которых может варьироваться в диапазоне от 100 до 500 нм. Затем методом самосборки субмикросферы полиметилметакрилата осаждались в упорядоченные матрицы (шаблоны) преимущественно с гранецентрированной кубической решёткой. Полученные мезопористые структуры, называемые искусственными опалами или коллоидными кристаллами, имели размеры порядка 10 ×10 × 2 мм. Затем опалы подвергались термической обработке до 120 °С для упрочнения шаблона перед пропиткой прекурсором. Далее опалы пропитывались золем кремнезёма с размером частиц от 1 до 5 нм, полученным путём гидролиза тетраэтоксисилана в присутствии соляной кислоты и затем, после отверждения и сушки пропитывающего состава на воздухе при комнатной температуре, подвергались многоступенчатому обжигу до 550 °С при нормальном давлении в воздушной атмосфере для удаления всех органических компонентов. В результате получались образцы макропористых метаматериалов (так называемые, инверсные или инвертированные опалы) с открытой системой пор размером до 400 нм, занимающих около 80 % объёма. В сканирующих электронных микроскопах TM4000 Plus, SU3500 и S-5500 с использованием макропористых структур были исследованы молочнокислые бактерии и красные кровяные тельца. Для улучшения визуализации использовались системы напыления металлов для покрытия поверхности инверсного опала тонкой плёнкой платины. Вспомогательным веществом в пробоподготовке выступала ионная жидкость VetexQ EM (Interlab LLC). Показано, что инверсный опал можно использовать как впитывающую подложку для пробоподготовки и экспресс-анализа в сканирующей электронной микроскопии без предварительной сушки, химической обработки или температурного воздействия биообъектов. Использование ионной жидкости в сочетании с впитывающей пористой средой позволяет сохранить первоначальную форму биологических структур. Показана возможность изучения морфологических особенностей биоструктур на примере эритроцитов человека и молочнокислых бактерий. Экспериментально установлено, что впитывающую подложку на основе инверсного опала можно использовать многократно при исследовании биологических объектов. Следовые остатки предыдущих проб, оставшиеся после отжига пластины, не вносят существенных искажений при проведении новых серий наблюдений. В нашем исследовании были получены высококачественные электронные микрофотографии биообъектов с высоким разрешением и контрастом. При этом за счёт использования инверсных опалов в качестве впитывающей подложки обеспечивается сокращение временных и финансовых затрат на исследования.
Смотреть статью,
РИНЦ
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Yehia M. R., Smolyarova T. E., Shabanov A. V., Sushko E. S., Badun G. A., Kudryasheva N. S.
Заглавие : Adaptation of a bacterial bioluminescent assay to monitor bioeffects of gold nanoparticles
Место публикации : Bioengineering. - 2022. - Vol. 9, Is. 2. - Ст.61. - ISSN 2306-5354(eISSN), DOI 10.3390/bioengineering9020061
Примечания : Cited References: 91. - This research was funded by RFBR, N18-29-19003; RFBR, Krasnoyarsk Territory and Krasnoyarsk Regional Fund of Science, N20-44-243001; and partly supported by the Program of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, Fundamental Study 2020–2025 (Russian Federation)
Аннотация: Our current study aimed to adapt a bioluminescent bacteria-based bioassay to monitor the bioeffects of gold nanoparticles (AuNPs). Luminous marine bacteria Photobacterium phosphoreum and AuNPs modified with polyvinylpyrrolidone were employed; low-concentration (≤10−3 g/L) bioeffects of AuNPs were studied. Bioluminescence intensity was used as an indicator of physiological activity in bacteria. Two additional methods were used: reactive oxygen species (ROS) content was estimated with a chemiluminescent luminol method, and bacterial size was monitored using electron microscopy. The bacterial bioluminescent response to AuNPs corresponded to the “hormesis” model and involved time-dependent bioluminescence activation, as well as a pronounced increase in the number of enlarged bacteria. We found negative correlations between the time courses of bioluminescence and the ROS content in bacterial suspensions, demonstrating the relationship between bioluminescence activation and bacterial ROS consumption. The combined effects of AuNPs and a beta-emitting radionuclide, tritium, revealed suppression of bacterial bioluminescent activity (as compared to their individual effects) and a reduced percentage of enlarged bacteria. Therefore, we demonstrated that our bacteria-based bioluminescence assay is an appropriate tool to study the bioeffects of AuNPs; the bioeffects can be further classified within a unified framework for rapid bioassessment.
Смотреть статью,
Scopus,
WOS,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Drokina T. V., Lisin V.V., Popova L.U., Balandina A. N., Bitekhtina M.A.
Заглавие : The NMR investigation of the electromagnetic irradiation effects on bacteria
Место публикации : Phys. Met. Metallogr. - Vol. 102, Suppl. 1. - С. S96-S97. - DOI 10.1134/S0031918X06140250
Примечания : Библиогр.: 4
Аннотация: The luminous marine bacteria (Photobacterium leiognathi, strain 54) are influenced by a nonthermal-intensity millimeter electromagnetic field, which was studied by nuclear magnetic resonance (NMR). It is shown that the proton spectrum of luminous bacteria depends on the electromagnetic irradiation effect (ν=42.2 GHz).
Читать в сети ИФ,
Смотреть статью
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Begunovich L. V., Kovaleva E. A., Korshunov M. M., Shabanov V. F.
Заглавие : Absorption spectra of the purple nonsulfur bacteria light-harvesting complex: A DFT study of the B800 part
Колич.характеристики :7 с
Место публикации : J. Photochem. Photobiol. A: Chem. - 2024. - Vol. 450. - Ст.115454. - ISSN 10106030 (ISSN), DOI 10.1016/j.jphotochem.2023.115454. - ISSN 18732666 (eISSN)
Примечания : Cited References: 42. - This work was supported by the state assignment of the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation. Authors would like to thank Information Technology Centre, Novosibirsk State University for providing access to their supercomputers. L.V.B. would like to thank Irkutsk Supercomputer Center of SB RAS for providing the access to HPC-cluster «Akademik V.M. Matrosov» (Irkutsk Supercomputer Center of SB RAS, Irkutsk: ISDCT SB RAS; http://hpc.icc.ru, accessed 20.10.2023)
Аннотация: We’ve studied the B800 part of Rhodoblastus acidophilus light-harvesting complex (LH2) by several quantum chemical techniques based on the density functional theory (DFT) and determined the specific method and a minimal reliable model suitable for further studies of the LH2. In addition to bacteriochlorophyll a molecules, the minimal model includes two α and one β chain amino acids. Within the model, we are able to reproduce the contribution of the B800 ring of nine bacteriochlorophyll a molecules to the near infrared Qy absorption band. We also discuss the use of hybrid DFT calculations for precise energy and optical estimations and DFT-based tight binding (DFTB) method for the large-scale calculations. Crucial importance of Hartree-Fock exchange interaction for the correct description of B800 peak position was shown.
Смотреть статью,
Scopus,
WOS
Найти похожие

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Kicheeva A. G., Sushko E. S., Bondarenko L. S., Kydralieva K. A., Pankratov D. A., Tropskaya N. S., Dzeranov A. A., Dzhardimalieva G. I., Zarrelli M., Kudryasheva N. S.
Заглавие : Functionalized magnetite nanoparticles: Characterization, bioeffects, and role of reactive oxygen species in unicellular and enzymatic systems
Место публикации : Int. J. Mol. Sci. - 2023. - Vol. 24, Is. 2. - Ст.1133. - ISSN 16616596 (ISSN), DOI 10.3390/ijms24021133. - ISSN 14220067 (eISSN)
Примечания : Cited References: 125. - This research was funded by Russian Science Foundation, N 22-73-10222
Аннотация: The current study evaluates the role of reactive oxygen species (ROS) in bioeffects of magnetite nanoparticles (MNPs), such as bare (Fe3O4), humic acids (Fe3O4-HA), and 3-aminopropyltriethoxysilane (Fe3O4-APTES) modified MNPs. Mössbauer spectroscopy was used to identify the local surrounding for Fe atom/ions and the depth of modification for MNPs. It was found that the Fe3O4-HA MNPs contain the smallest, whereas the Fe3O4-APTES MNPs contain the largest amount of Fe2+ ions. Bioluminescent cellular and enzymatic assays were applied to monitor the toxicity and anti-(pro-)oxidant activity of MNPs. The contents of ROS were determined by a chemiluminescence luminol assay evaluating the correlations with toxicity/anti-(pro-)oxidant coefficients. Toxic effects of modified MNPs were found at higher concentrations (10−2 g/L); they were related to ROS storage in bacterial suspensions. MNPs stimulated ROS production by the bacteria in a wide concentration range (10−15–1 g/L). Under the conditions of model oxidative stress and higher concentrations of MNPs (10−4 g/L), the bacterial bioassay revealed prooxidant activity of all three MNP types, with corresponding decay of ROS content. Bioluminescence enzymatic assay did not show any sensitivity to MNPs, with negligible change in ROS content. The results clearly indicate that cell-membrane processes are responsible for the bioeffects and bacterial ROS generation, confirming the ferroptosis phenomenon based on iron-initiated cell-membrane lipid peroxidation.
Смотреть статью,
Scopus,
WOS,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

Вид документа : Статья из сборника (однотомник)
Шифр издания :
Автор(ы) : Semenov S. V., Knyazev Yu. V., Balaev D. A., Karnachuk O. V., Ikkert O. P.
Заглавие : Biosyntesis of magnetic nanocomposites using sulfate-reducing bacteria
Коллективы : Байкальская международная конференция "Магнитные материалы. Новые технологии", "Магнитные материалы. Новые технологии", Байкальская международная конференция, "Magnetic materials. New tecnologies", Baikal International Conference, Иркутский государственный университет
Место публикации : Магнитные материалы. Новые технологии: тез. докл. IX Байкал. междунар. конф. BICMM-2023/ чл. прогр. ком.: S. S. Aplesnin [et al.] ; чл. орг. ком. R. S. Iskhakov [et al.]. - Иркутск, 2023. - P.170. - ISBN 978-5-00133-051-6, DOI 10.26516/978-5-9624-2178-0.2023.1-207
Примечания : Библиогр.: 2
Материалы конференции,
Материалы конференции,
Читать в сети ИФ
Найти похожие

10.

Вид документа : Статья из журнала
Шифр издания :
Автор(ы) : Stolyar S. V., Chekanova L. A., Yaroslavtsev R. N., Ladygina V. P., Tirranen L. S.
Заглавие : Effect of nanoparticles in growth of test - bacteria
Коллективы : International Scientific Conference "Conference on Applied Physics, Information Technologies and Engineering"
Место публикации : J. Phys. Conf. Ser. - 2019. - Vol. 1399. - Ст.022029. - ISSN 1742-6588, DOI 10.1088/1742-6596/1399/2/022029. - ISSN 1742-6596 (eISSN)
Примечания : Cited References: 10
Предметные рубрики: Applied Physics
Аннотация: Confident effect of five magnetic composite nanoparticles (FeP@Ag, FeP@Pd, CoP, NiP, Fe2O3@AГ) on growth of test bacteria colonies (Acinetobacter baumannii, Еscherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus) in five replicates each is considered. Reliable inhibitors of colonies of all five test bacteria were nanoparticles FeP@Ag. CoP nanoparticles are reliable inhibitors of growth of 4 test bacteria (except for test bacteria Escherichia сoli). NiP nanoparticles are reliable inhibitors of growth of 2 test bacteria: Escherichia сoli and Klebsiella pneumoniae. Bacteria Escherichia сoli were most sensitive to the effect of magnetic nanoparticles; and bacteria Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus were most resistant to the effect of magnetic nanoparticles. The prospects of the method are in the possibility of multiple reuse of the magnetic particles with antimicrobial properties for bacterial decontamination of the studied sources of water and removal of magnetic nanoparticles from the treated liquids by electromagnet. The method can find use in water treatment facilities for household, Industrial and medical wastes.
Смотреть статью,
Scopus,
WOS,
Читать в сети ИФ
Найти похожие