Библиотека института физики им. Л.В. Киренского СО РАН

Главная

Базы данных

Труды сотрудников ИФ СО РАН - результаты поиска

Вид поиска

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН

Каталог журналов библиотеки ИФ СО РАН

Труды сотрудников ИФ СО РАН

Область поиска

Формат представления найденных документов:
полный	информационный	краткий

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>K=аптамеры<.>)

Общее количество найденных документов : 3
Показаны документы с 1 по 3

Селекция ДНК-аптамеров для диагностики рака молочной железы / Г. С. Замай [и др.] // Биомедицинская химия. - 2016. - Т. 62, № 4. - С. 411-417, DOI 10.18097/PBMC20166204411. - Библиогр.: 23 . - ISSN 2310-6972
Кл.слова (ненормированные):
ДНК-аптамеры -- олигонуклеотиды -- рак молочной железы -- Selex
Аннотация: Описан метод селекции ДНК-аптамеров к опухолевой ткани молочной железы с использованием послеоперационного материала. В качестве позитивных мишеней были использованы ткани рака молочной железы, в качестве негативных мишеней - ткани доброкачественной опухоли; условно здоровые ткани молочной железы, прилегающие к опухолевой; ткани молочной железы от больных мастопатией; ткани злокачественных опухолей других типов. В результате селекции был получен пул ДНК-аптамеров, селективно связывающийся с клетками и тканями рака молочной железы и незначительно связывающийся с доброкачественными опухолями молочной железы. Полученные ДНК-аптамеры могут быть использованы для идентификации белков-биомаркеров, диагностики рака молочной железы, адресной доставки противоопухолевых препаратов.

РИНЦ,
Scopus,
Смотреть статью,
Читать в сети ИФ

Переводная версия Selection of DNA aptamers for breast cancer [Текст] / G. S. Zamay, I. V. Belyanina, A. S. Zamay [et al.] // Biochem. Mosc.-Suppl. Ser. B-Biomed. Chem. - 2016. - Vol. 10 Is. 2.- P.158-164

Держатели документа:
Институт физики СО РАН
Красноярский государственный медицинский университет им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого (КрасГМУ)
Красноярский краевой клинический онкологический диспансер им. А.И. Крыжановского (КККОД)

Доп.точки доступа:
Замай, Галина Сергеевна; Zamay G. S.; Белянина, И. В.; Belayanina I. V.; Замай, Анна Сергеевна; Zamay A. S.; Комарова, М. А.; Komarova M. A.; Крат, А. В.; Krat A. V.; Еремина, Е. Н.; Eremina E. N.; Зуков, Р. А.; Zukov R. A.; Соколов, Алексей Эдуардович; Sokolov, A. E.; Замай, Т. Н.; Zamay T. N.
}
Найти похожие

    Адресная деструкция злокачественных опухолей биоконъюгатами на основе аптамеров / А. В. Дубынина [и др.] // Сиб. мед. обозрение. - 2016. - Т. 101, № 5. - С. 88-90. - Библиогр.: 2 . - ISSN 1819-9496
   Перевод заглавия: Targeted destruction of malignant tumors by bioconjugates on the base of aptamers
Кл.слова (ненормированные):
аптамеры -- золотые наночастицы -- магнитные микродиски -- гипертермия -- плазмонный -- резонанс -- aptamers -- gold nanoparticles -- magnetic microdiscs -- hyperthermia -- plasmon resonance
Аннотация: Широкое распространение в терапии онкологических заболеваний в последние годы получили методы, основанные на применении различных типов наночастиц. Для повышения адресности Адресная деструкция злокачественных опухолей биоконъюгатами на основе аптамеров воздействия применяют различные молекулы, обладающие высокой специфичностью, одними из которых являются аптамеры. В работе исследовался эффект воздействия на опухоль конъюгатов наночастиц золота с аптамерами при воздействии лазера, а также оценивалась гибель клеток опухоли при использовании конъюгатов магнитных микродисков с аптамерами в условиях переменного магнитного поля. Исследование показало возможность применения исследуемых конъюгатов в качестве средств адресной деструкции опухоли.
Widespread in cancer therapy in recent years have become the methods based on the use of different types of nanoparticles. To improve the targeting of the impact are used various molecules having high specificity, some of them are aptamers. The paper studied the effect of influence on the tumor the conjugates of gold nanoparticles with aptamers at laser exposure, as well as tumor cell death was assessed after using the conjugates of magnetic microdiscs with aptamers in a variable magnetic field. The study showed the possibility of using the studied conjugates as agents of targeted destruction of tumor.

РИНЦ,
Читать в сети ИФ
Держатели документа:
Институт физики СО РАН
ФГАОУ ВО «Сибирский федеральный университет»
ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени проф. В. Ф. Войно-Ясенецкого
Центр ядерной медицины Сибирского клинического центра ФМБА России

Доп.точки доступа:
Дубынина, А. В.; Dubynina A. V.; Замай, Т. Н.; Zamay T. N.; Коловская, О. С.; Kolovskaya O. S.; Кичкайло, Анна Сергеевна; Kichkaylo A.S.; Белянина, И. В.; Belyanina I. V.; Чанчикова, Н. Г.; Chanchikova N. G.; Токарев, Н. А.; Tokarev N. A.; Карлова, Е. А.; Karlova E. A.; Александровский, Александр Сергеевич; Aleksandrovskiy, A. S.; Шепелевич, Н. В.; Shepelevich N. V.; Озерская, А. В.; Ozerskaya A.V.; Бадрин, Е. А.; Badrin E. A.; Белугин, К. В.; Belugin K. V.; Белкин, С. А.; Belkin S. A.; Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого
}
Найти похожие

    Получение высокоселективных аптамеров к онколитическому вирусу VV-GMCSF-Lact. Теоретические и экспериментальные подходы / М. А. Дымова, Е. В. Кулигина, В. А. Рихтер [и др.] // Сиб. мед. обозрение. - 2023. - № 5. - С. 95-101 ; Sib. Med. Rev., DOI 10.20333/25000136-2023-5-95-101. - Библиогр.: 21. - Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 22-64-00041, https://rscf.ru/project/22-64-00041/. Работа также поддержана в рамках государственного задания ИХБФМ СО РАН No121030200173-6 (наработка вируса). Авторы благодарят Межведомственный суперкомпьютерный центр Российской академии наук (МСЦ РАН) за предоставление вычислительных мощностей . - ISSN 1819-9496. - ISSN 2500-0136
   Перевод заглавия: Obtaining highly selective aptamers to the VV-GMCSF-Lact oncolytic virus. Theoretical and experimental approaches
Кл.слова (ненормированные):
аптамеры -- SELEX -- онколитический вирус VV-GMCSF-Lact -- цитофлуориметрия -- молекулярная динамика -- компьютерное моделирование -- aptamers -- SELEX -- VV-GMCSF-Lact oncolytic virus -- cytofluorimetry -- molecular dynamics -- computer modelling
Аннотация: Введение. Деструкция злокачественных опухолей с помощью онколитических вирусов – один из наиболее эффективных и безопасных способов противоопухолевой терапии. Для получения доступа к опухолевым клеткам вирус должен длительное время циркулировать в кровотоке, избегая действия иммунной системы. Однако при введении вируса в организм он провоцирует выработку вируснейтрализующих антител, снижающих его противоопухолевый эффект. Наиболее эффективным способом защиты вируса от нейтрализующих антител является его экранирование, в частности, с помощью селективных к нему ДНК-аптамеров. Цель исследования. С помощью экспериментальных методов и теоретических расчётов разработать подходящие для создания противоопухолевого препарата на основе онколитического вируса VV-GMCSF-Lact ДНК-аптамеры, эффективно экранирующие вирусы и способные защитить их от вируснейтрализующих антител. Материал и методы. Моделирование вторичных структур аптамеров выполнено в программе для фолдинга нуклеиновых кислот mFold, моделирование соответствующих пространственных полноатомных структур аптамеров – в программах SimRNA и VMD. Расчёты молекулярной динамики проведены в программном пакете GROMACS 2018.8. Кластерный анализ полученных молекулярно-динамических траекторий выполнен в программе VMD. Оценка связывания Cy5-модифицированных аптамеров с вирусом проведена с помощью проточной цитометрии на цитофлуориметре BD FACSCanto II (Becton Dickinson, г. Франклин Лейкс, Нью-Джерси, США). Результаты. Модификация аптамеров, экспериментально полученных с помощью технологии SELEX, позволила получить пять укороченных олигонуклеотидов NV1t_72, NV4t_64, NV4t_53, NV14t_41 и NV14t_57, экранирующих онколитический вирус VV-GMCSF-Lact, самым эффективным из которых оказался аптамер NV14t_57. Теоретические расчёты показали, что аффинность аптамеров определяется их трёхмерной структурой, зависящей от способа модификации. Заключение. Получен высокоселективный аптамер NV14t_57, который является наиболее перспективным кандидатом для дальнейшей работы по созданию препарата для противоопухолевой терапии онкологических заболеваний на основе онколитического вируса осповакцины VVGMCSF-Lact.
Introduction. Destruction of malignant tumours with oncolytic viruses is one of the most effective and safe methods of antitumor therapy. To gain access to tumour cells, the virus must circulate in the bloodstream for a long time, avoiding the action of the immune system. However, when a virus is introduced into the body, it provokes the production of virus-neutralising antibodies that reduce its antitumor effect. The most effective way to protect a virus from antibodies that neutralise it is to screen it: in particular, using selective DNA aptamers. The aim of the research. Using experimental methods and theoretical calculations, to develop DNA aptamers suitable for creating an antitumor drug based on the VV-GMCSF-Lact oncolytic virus, which effectively screen viruses and can protect them from virus-neutralising antibodies. Material and methods. Modelling of the secondary structures of aptamers was performed using the mFold program for nucleic acid folding, modelling of the corresponding spatial full-atom structures of aptamers was performed using the SimRNA and VMD programs. Molecular dynamics calculations were carried out using the GROMACS 2018.8 software package. Cluster analysis of the obtained molecular dynamic trajectories was performed using the VMD program. Binding of Cy5-modified aptamers to the virus was assessed using flow cytometry on a BD FACSCanto II cytometer (Becton Dickinson, Franklin Lakes, New Jersey, USA). Results. Modification of aptamers experimentally obtained using the SELEX technology made it possible to obtain five truncated oligonucleotides NV1t_72, NV4t_64, NV4t_53, NV14t_41, and NV14t_57, which screen the oncolytic virus VV-GMCSF-Lact, the most effective of which was the NV14t_57 aptamer. Theoretical calculations have shown that the affinity of aptamers is determined by their three-dimensional structure, which depends on the method of modification. Conclusion. A highly selective aptamer NV14t_57 has been obtained, which is the most promising candidate for further work on the creation of a drug for antitumor therapy of oncological diseases based on the VV-GMCSF-Lact oncolytic vaccinia virus.

Смотреть статью,
РИНЦ,
Scopus
Держатели документа:
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск 630090, Российская Федерация
Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В. Ф. Войно-Ясенецкого, Красноярск 660022, Российская Федерация
Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр» СО РАН, Красноярск 660036, Российская Федерация
Сибирский федеральный университет, Красноярск 660041, Российская Федерация
Институт физики им. Л. В. Киренского СО РАН, Красноярск 660036, Российская Федерация

Доп.точки доступа:
Дымова, М. А.; Кулигина, Е. В.; Рихтер, В. А.; Артюшенко, П. В.; Рогова, А. В.; Щугорева, И. А.; Томилин, Феликс Николаевич; Tomilin, F. N.; Кичкайло, А. С.; Замай, Т. Н.

}
Найти похожие