Библиотека института физики им. Л.В. Киренского СО РАН

Главная

Базы данных

Труды сотрудников ИФ СО РАН - результаты поиска

Вид поиска

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН

Каталог журналов библиотеки ИФ СО РАН

Труды сотрудников ИФ СО РАН

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД:

Каталог книг и брошюр библиотеки ИФ СО РАН (2)

Формат представления найденных документов:
полный	информационный	краткий

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>K=modelling<.>)

Общее количество найденных документов : 17
Показаны документы с 1 по 10

1-10 11-17

Synthesis and structure of 4-methyl-3-nitro-1-nitromethyl-1H-1,2,4- triazolium perchlorate [Text] / A. M. Astachov, A. A. Erashov [et al.] // Energetic materials: characterisation, modelling and validation : Proceedings of the 40th International Annual Conference of ICT. - P104

Материалы конференции

Доп.точки доступа:
Astachov, A.M.; Erashov, A.A.; Vasiliev, A.D.; Buka, E.S.; "Energetic materials: characterisation, modelling and validation", International Annual Conference of ICT(40 ; 2009 ; June ; 23-26 ; Karlsruhe, Germany)
}
Найти похожие

Magneto-optical study of Friedericksz threshold in polymer dispersed nematic liquid crystals / O. O. Prishchepa [et al.] // Mol. Cryst. Liquid Cryst. - 2008. - Vol. 488, Is. 1. - P. 309-316, DOI 10.1080/15421400802241167. - Cited Reference Count: 11 . - ISSN 1542-1406
Рубрики:

Кл.слова (ненормированные):
Friedericksz threshold -- nematic -- magneto-optics -- polymer dispersed liquid crystals -- surface anchoring -- Friedericksz threshold -- Magneto-optics -- Nematic -- Polymer dispersed liquid crystals -- Surface anchoring -- Computer systems -- Crystallography -- Drop formation -- Drops -- Fluid mechanics -- Light sources -- Liquid crystals -- Magnetos -- Optical engineering -- Powders -- Approximate formulas -- Calculation data -- Computer modelling -- Friedericksz threshold -- Magneto-optical -- Magneto-optics -- Measured values -- Nematic -- Nematic droplets -- Poly vinyl butyral -- Polymer dispersed liquid crystals -- Reorientation processes -- Surface anchoring -- Threshold fields -- Nematic liquid crystals
Аннотация: A computer model of reorientation processes in the bipolar nematic droplets of ellipsoidal form with strong tangential anchoring has been developed. The approximate formula to estimate the Friedericksz threshold has been obtained when the operating field (electric or magnetic) is orthogonal to the bipolar axis. The dependence of the threshold field on the droplet form has been considered. The reorientation of the bipolar droplets of 5CB nematic liquid crystal dispersed in polyvinylbutyral has been studied by the magneto-optical method. The calculation data are in good agreement with measured values of the threshold field.

WOS,
Scopus,
eLibrary
Держатели документа:
Siberian Fed Univ, SB RAS, LV Kirensky Phys Inst, Krasnoyarsk Sci Ctr, Krasnoyarsk 660036, Russia

Доп.точки доступа:
Prishchepa, O. O.; Parshin, A. M.; Паршин, Александр Михайлович; Shabanov, A. V.; Шабанов, Александр Васильевич; Zyryanov, V. Ya.; Зырянов, Виктор Яковлевич; International Topical Meeting on Optics of Liquid Crystals(12th ; OCT 01-05, 2007 ; Puebla, MEXICO)
}
Найти похожие

Microstructural parameters for modelling of superconducting foams / M. R. Koblischka, A. Koblischka-Veneva, Q. Nouailhetas [et al.] // Materials. - 2022. - Vol. 15, Is. 6. - Ст. 2303, DOI 10.3390/ma15062303. - Cited References: 62 . - ISSN 1996-1944
Кл.слова (ненормированные):
superconducting foams -- YBCO -- microstructure -- modelling parameters -- foam cells -- current flow
Аннотация: Superconducting YBa2Cu3Oy (YBCO) foams were prepared using commercial open-cell, polyurethane foams as starting material to form ceramic Y2 BaCuO5 foams which are then converted into superconducting YBCO by using the infiltration growth process. For modelling the supercon-ducting and mechanical properties of the foam samples, a Kelvin-type cell may be employed as a first approach as reported in the literature for pure polyurethane foams. The results of a first modelling attempt in this direction are presented concerning an estimation of the possible trapped fields (TFs) and are compared to experimental results at 77 K. This simple modelling revealed already useful information concerning the best suited foam structure to realize large TF values, but it also became obvious that for various other parameters like magnetostriction, mechanical strength, percolative current flow and the details of the TF distribution, a refined model of a superconducting foam sample incorporating the real sample structure must be considered. Thus, a proper description of the specific microstructure of the superconducting YBCO foams is required. To obtain a set of reliable data, YBCO foam samples were investigated using optical microscopy, scanning electron microscopy and electron backscatter diffraction (EBSD). A variety of parameters including the size and shape of the cells and windows, the length and shape of the foam struts or ligaments and the respective intersection angles were determined to better describe the real foam structure. The investigation of the foam microstructures revealed not only the differences to the original polymer foams used as base material, but also provided further insights to the infiltration growth process via the large amount of internal surface in a foam sample.

Смотреть статью,
Scopus,
Читать в сети ИФ
Держатели документа:
Experimental Physics, Saarland University, P.O. Box 151150, Saarbrucken, D-66041, Germany
GREEN, Universite de Lorraine, Nancy, F-54000, France
Kirensky Institute of Physics, Federal Research Center KSC SB RAS, Krasnoyarsk, 660036, Russian Federation

Доп.точки доступа:
Koblischka, M. R.; Koblischka-Veneva, A.; Nouailhetas, Q.; Hajiri, G.; Berger, K.; Douine, B.; Gokhfeld, D. M.; Гохфельд, Денис Михайлович
}
Найти похожие

New approach in modelling magnetic micro-structure and magnetization reversal / A. V. Izotov, B. A. Belyaev, An. Leksikov // 19th Soft Magnetic Materials Conference : [7-9 sep. 2009, Torino, Italy] : abstracts. - Torino, 2009. - Ст. B2-11

Доп.точки доступа:
Izotov, A. V.; Изотов, Андрей Викторович; Belyaev, B. A.; Беляев, Борис Афанасьевич; Leksikov, An. A.; Лексиков, Андрей Александрович; Soft Magnetic Materials Conference(19 ; 2009 ; SEP ; Torino, Italy)
}
Найти похожие

    Получение высокоселективных аптамеров к онколитическому вирусу VV-GMCSF-Lact. Теоретические и экспериментальные подходы / М. А. Дымова, Е. В. Кулигина, В. А. Рихтер [и др.] // Сиб. мед. обозрение. - 2023. - № 5. - С. 95-101 ; Sib. Med. Rev., DOI 10.20333/25000136-2023-5-95-101. - Библиогр.: 21. - Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 22-64-00041, https://rscf.ru/project/22-64-00041/. Работа также поддержана в рамках государственного задания ИХБФМ СО РАН No121030200173-6 (наработка вируса). Авторы благодарят Межведомственный суперкомпьютерный центр Российской академии наук (МСЦ РАН) за предоставление вычислительных мощностей . - ISSN 1819-9496. - ISSN 2500-0136
   Перевод заглавия: Obtaining highly selective aptamers to the VV-GMCSF-Lact oncolytic virus. Theoretical and experimental approaches
Кл.слова (ненормированные):
аптамеры -- SELEX -- онколитический вирус VV-GMCSF-Lact -- цитофлуориметрия -- молекулярная динамика -- компьютерное моделирование -- aptamers -- SELEX -- VV-GMCSF-Lact oncolytic virus -- cytofluorimetry -- molecular dynamics -- computer modelling
Аннотация: Введение. Деструкция злокачественных опухолей с помощью онколитических вирусов – один из наиболее эффективных и безопасных способов противоопухолевой терапии. Для получения доступа к опухолевым клеткам вирус должен длительное время циркулировать в кровотоке, избегая действия иммунной системы. Однако при введении вируса в организм он провоцирует выработку вируснейтрализующих антител, снижающих его противоопухолевый эффект. Наиболее эффективным способом защиты вируса от нейтрализующих антител является его экранирование, в частности, с помощью селективных к нему ДНК-аптамеров. Цель исследования. С помощью экспериментальных методов и теоретических расчётов разработать подходящие для создания противоопухолевого препарата на основе онколитического вируса VV-GMCSF-Lact ДНК-аптамеры, эффективно экранирующие вирусы и способные защитить их от вируснейтрализующих антител. Материал и методы. Моделирование вторичных структур аптамеров выполнено в программе для фолдинга нуклеиновых кислот mFold, моделирование соответствующих пространственных полноатомных структур аптамеров – в программах SimRNA и VMD. Расчёты молекулярной динамики проведены в программном пакете GROMACS 2018.8. Кластерный анализ полученных молекулярно-динамических траекторий выполнен в программе VMD. Оценка связывания Cy5-модифицированных аптамеров с вирусом проведена с помощью проточной цитометрии на цитофлуориметре BD FACSCanto II (Becton Dickinson, г. Франклин Лейкс, Нью-Джерси, США). Результаты. Модификация аптамеров, экспериментально полученных с помощью технологии SELEX, позволила получить пять укороченных олигонуклеотидов NV1t_72, NV4t_64, NV4t_53, NV14t_41 и NV14t_57, экранирующих онколитический вирус VV-GMCSF-Lact, самым эффективным из которых оказался аптамер NV14t_57. Теоретические расчёты показали, что аффинность аптамеров определяется их трёхмерной структурой, зависящей от способа модификации. Заключение. Получен высокоселективный аптамер NV14t_57, который является наиболее перспективным кандидатом для дальнейшей работы по созданию препарата для противоопухолевой терапии онкологических заболеваний на основе онколитического вируса осповакцины VVGMCSF-Lact.
Introduction. Destruction of malignant tumours with oncolytic viruses is one of the most effective and safe methods of antitumor therapy. To gain access to tumour cells, the virus must circulate in the bloodstream for a long time, avoiding the action of the immune system. However, when a virus is introduced into the body, it provokes the production of virus-neutralising antibodies that reduce its antitumor effect. The most effective way to protect a virus from antibodies that neutralise it is to screen it: in particular, using selective DNA aptamers. The aim of the research. Using experimental methods and theoretical calculations, to develop DNA aptamers suitable for creating an antitumor drug based on the VV-GMCSF-Lact oncolytic virus, which effectively screen viruses and can protect them from virus-neutralising antibodies. Material and methods. Modelling of the secondary structures of aptamers was performed using the mFold program for nucleic acid folding, modelling of the corresponding spatial full-atom structures of aptamers was performed using the SimRNA and VMD programs. Molecular dynamics calculations were carried out using the GROMACS 2018.8 software package. Cluster analysis of the obtained molecular dynamic trajectories was performed using the VMD program. Binding of Cy5-modified aptamers to the virus was assessed using flow cytometry on a BD FACSCanto II cytometer (Becton Dickinson, Franklin Lakes, New Jersey, USA). Results. Modification of aptamers experimentally obtained using the SELEX technology made it possible to obtain five truncated oligonucleotides NV1t_72, NV4t_64, NV4t_53, NV14t_41, and NV14t_57, which screen the oncolytic virus VV-GMCSF-Lact, the most effective of which was the NV14t_57 aptamer. Theoretical calculations have shown that the affinity of aptamers is determined by their three-dimensional structure, which depends on the method of modification. Conclusion. A highly selective aptamer NV14t_57 has been obtained, which is the most promising candidate for further work on the creation of a drug for antitumor therapy of oncological diseases based on the VV-GMCSF-Lact oncolytic vaccinia virus.

Смотреть статью,
РИНЦ,
Scopus
Держатели документа:
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск 630090, Российская Федерация
Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В. Ф. Войно-Ясенецкого, Красноярск 660022, Российская Федерация
Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр» СО РАН, Красноярск 660036, Российская Федерация
Сибирский федеральный университет, Красноярск 660041, Российская Федерация
Институт физики им. Л. В. Киренского СО РАН, Красноярск 660036, Российская Федерация

Доп.точки доступа:
Дымова, М. А.; Кулигина, Е. В.; Рихтер, В. А.; Артюшенко, П. В.; Рогова, А. В.; Щугорева, И. А.; Томилин, Феликс Николаевич; Tomilin, F. N.; Кичкайло, А. С.; Замай, Т. Н.

}
Найти похожие

    Применение процессного моделирования для интерпретации вариации стабильных изотопов в годичных кольцах деревьев / Н. Д. Васильева, С. Н. Софронова, В. В. Баринов [и др.] // Лесотехнич. журн. - 2023. - Т. 13, № 4, Ч. 2. - С. 23-38 ; Forest. Eng. J., DOI 10.34220/issn.2222-7962/2023.4/15. - Библиогр.: 33. - Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 21-17-00006, (https://rscf.ru/en/project/21-17-00006/) . - ISSN 2222-7962
   Перевод заглавия: Application of process-based modelling for interpretation of stable isotope variations in tree rings
Кл.слова (ненормированные):
дендрохрогология -- стабильные изотопы -- моделирование -- углерод -- кислород -- водород -- dendrochronology -- stable isotopes -- modelling -- carbon -- oxygen -- hydrogen
Аннотация: Ширина годичных колец деревьев и изотопный состав стабильных изотопов углерода (δ13C), кислорода (δ18O) и водорода (δ2H) в целлюлозе годичных колец широко используются для реконструкций условий окружающей среды. Применение моделей, способных описать вариацию стабильных изотопов в годичных кольцах деревьев, представляет собой набор инструментов для интерпретации изменений окружающей среды на экофизиологическом уровне. В данной работе хронологии с погодичным временным разрешением, полученные по стабильным изотопам δ13С, δ18O и δ2H в целлюлозе годичных колец хвойных для региона Дельта реки Маккензи в Канаде (68° 30′ с.ш., 133° 48′ з.д.) для периода с 1901 по 2009 гг., были сопоставлены с модельными расчетами для интерпретации экофизиологического сигнала. При помощи процессной модели (LPX) нам удалось смоделировать δ13С вариацию, значимо коррелирующую с измеренными данными (r = 0.29; p = 0.002) для периода с 1901 по 2009 гг. Модельные расчеты по кислороду и водороду требуют дальнейшего преобразования модельных блоков, в частности, требуют доработки включения источника воды, используемой деревьями, блока оттаивания и промерзания почвы с учетом вечной мерзлоты, а также экспериментальных данных по содержанию δ18O и δ2H в воде.
Tree-ring width and stable isotopes (carbon, oxygen, and hydrogen) in tree-ring cellulose are widely used to reconstruct environmental conditions. The application of models capable to describe a variation of stable isotopes in annual tree rings can be a powerful tool for interpretation of environmental changes at the eco-physiological level. In this paper, we modelled carbon (δ13С), oxygen (δ18O), and hydrogen (δ2H) variations at the tree-ring level and compared results with measured data, obtained from the Mackenzie Delta River (68°30′ N, 133°48′ W) for the common period from 1901 to 2009. Using a process-based model (LPX), we were able to simulate carbon isotope values, which significantly (r = 0.29; p = 0.002) correlate with measured carbon isotope values. The model calculations for oxygen and hydrogen require further modifications and improvements, in particular the inclusion of the source of water used by the trees in the Canadian subarctic, as well as δ18O and δ2H in the water.

Смотреть статью,
РИНЦ,
Читать в сети ИФ
Держатели документа:
Сибирский Федеральный Университет, 660041, пр. Свободный, 79, Красноярск, Российская Федерация
Институт физики им. Л.В. Киренского СО РАН, Академгородок, 50, г. Красноярск, Российская Федерация, 660036
Сибирский государственный университет науки и технологий имени академика М.Ф. Решетнева, Красноярск, Красноярский рабочий 31, 660037, Российская Федерация

Доп.точки доступа:
Васильева, Наталья Дмитриевна; Vasilieva, N. D.; Софронова, Светлана Николаевна; Sofronova, S. N.; Баринов, В. В.; Тайник, А. В.; Трушкина, Т. В.; Чуракова, О. В.; РусДендро-2023, Международная дендрохронологическая конференция(5 ; сентябрь 2023г. ; Воронеж)

}
Найти похожие

Modelling of inelastic electron scattering cross section in layered nanostructures [Text] / Parshin A.S.,, Kushchenkov S.A., Alexandrova G.A. // Physics of Electronic Materials : 3rd International Conference Proceedings : Kaluga, Russia, Oktober 1-4, 2008 / ed. K.G. Nikiforov. - Kaluga : KSPU Press, 2008. - Vol. 1. - p. 231

Доп.точки доступа:
Parshin, A.S.; Kushchenkov, S.A. ; Alexandrova, G.A. ; "Physics of Electronic Materials", International Conference(3 ; 2008 : Oct. ; Kaluga)
}
Найти похожие

Density-functional study of the Si/SiO2 interfaces in short-period superlattices: Vibrational states and Raman spectra / M. Smirnov, E. Roginskii, A. Savin [et al.] // Photonics. - 2023. - Vol. 10, Is. 8. - Ст. 902, DOI 10.3390/photonics10080902. - Cited References: 61. - The study was supported by grants from the Russian Science Foundation (project No. 22-22-20021) and the Saint-Petersburg Science Center (project No. 32/2022), using the resources of the Computing Center and the Center for Optical and Laser Materials Research at the Research Park of St. Petersburg State University. - The study was performed using the resources of the Computing Center and the Center for Optical and Laser Materials Research at the Research Park of St. Petersburg State University. The authors thank Konstantin Smirnov for his valuable advice. The calculations were also performed in part using the facilities of the JSCC supercomputer center at RAS and the Konstantinov computational center at the Ioffe Institute . - ISSN 2304-6732
Кл.слова (ненормированные):
silicon -- cristobalite -- interface -- superlattice -- Raman spectra -- DFT modelling
Аннотация: Raman spectroscopy has proven its effectiveness as a highly informative and sensitive method for the nondestructive analysis of layered nanostructures and their interfaces. However, there is a lack of information concerning the characteristic phonon modes and their activity in Si/SiO2 nanostructures. In order to overcome this problem, the phonon states and Raman spectra of several Si/SiO2 superlattices (SL) with layer thicknesses varied within 0.5–2 nm are studied using DFT-based computer modeling. Two types of structures with different interfaces between crystalline silicon and SiO2 cristobalite were studied. A relationship between the phonon states of heterosystems and the phonon modes of the initial crystals was established. Estimates of the parameters of deformation potentials are obtained, with the help of which the shifts of phonon frequencies caused by elastic strains in the materials of the SL layers are interpreted. The dependence of intense Raman lines on the SL structure has been studied. Several ways have been proposed to use this information, both for identifying the type of interface and for estimating the structural parameters. The obtained information will be useful for the spectroscopic characterization of the silicon/oxide interfaces.

Смотреть статью,
Scopus,
WOS
Держатели документа:
Faculty of Physics, Saint-Petersburg State University, Universitetskaya nab. 7/9, Saint-Petersburg 199034, Russia
Laboratory of Spectroscopy of Solid State, Ioffe Institute, Politehnicheskaya St. 26, Saint-Petersburg 194021, Russia
Laboratory of Molecular Spectroscopy, Kirensky Institute of Physics, Federal Research Center KSC SB RAS, Akademgorodok St. 50/38, Krasnoyarsk 660036, Russia
School of Engineering and Construction, Siberian Federal University, Svobodny pr. 82, Krasnoyarsk 660041, Russia
Center for Optical and Laser Materials Research, Research Park, Saint-Petersburg State University, Universitetskaya nab. 7/9, Saint-Petersburg 199034, Russia

Доп.точки доступа:
Smirnov, Mikhail; Roginskii, Evgenii; Savin, Aleksandr; Oreshonkov, A. S.; Орешонков, Александр Сергеевич; Pankin, Dmitrii
}
Найти похожие

Numerical Simulations of Negative-Index Nanocomposite and Back ward-Wave Photonic Microdevices / A. K. Popov, S. A. Myslivets // International Conference on Modelling and Si mulations, ICMS 2010 : 22-25 Janiary 2010, Cape Town, South Africa: Proceeding. - 2010. - Vol. 61. - P107–121

Доп.точки доступа:
Popov, A.K.; Myslivets, S.A.; International Conference on Modelling and Simulations(2010 ; Jan. ; Cape Town, South Africa); World Academy of Science, Engineering and Technology
}
Найти похожие

10.

Molecular dynamical modelling of endohedral fullerenes formation in plasma / A. S. Fedorov [et al.] // IOP Conf. Ser.: Mater. Sci. Eng. - 2016. - Vol. 110, Is. 1, DOI 10.1088/1757-899X/110/1/012078
Аннотация: The initial stages of fullerene and endohedral metallofullerene (EMF) synthesis in carbon-helium plasma at 1500 K and 2500 K have been simulated with quantum chemical molecular dynamics (MD) based on density-functional tight-binding (DFTB). The cases of formation of large (>100 atoms) sp2-carbon clusters with scandium atoms inside were observed. These clusters are considered as precursors of fullerenes or EMFs, and thus it is shown that formation of EMFs can be explained within the framework of »shrinking hot giant« mechanism. Also, the dependence of formation rates on plasma parameters, including temperature, buffer gas and metal atoms concentrations, has been studied.

Scopus,
Смотреть статью,
WOS,
Читать в сети ИФ

Доп.точки доступа:
Fedorov, A. S.; Федоров, Александр Семенович; Kovaleva, E. A.; Lubkova, T. A.; Popov, Z. I.; Попов, Захар Иванович; Kuzubov, A. A.; Кузубов, Александр Александрович; Visotin, M. A.; Irle, S.; International Scientific Conference on Radiation-Thermal Effects and Processes in Inorganic Materials(11 ; 31 Aug. - 10 Sept. 2015)
}
Найти похожие